40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_R0022 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_R0022  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0045  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0045  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0043  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000221825  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0046  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000910848  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0043  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000282186  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0043  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.174816  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0053  tRNA-Val  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000250607  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0003  tRNA-Ile  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000155812  hitchhiker  0.0000000064789 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0059  tRNA-Val  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000382947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0065  tRNA-Val  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0059636  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0003  tRNA-Ile  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000227262  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0044  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0237492  normal  0.0570511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0063  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000469016  normal  0.343249 
 
 
-
 
NC_003295  RS00235  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00686486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0054  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000352314  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0047  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0058  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00611811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0069  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0826408  hitchhiker  0.0022549 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0076  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0071  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00796346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0063  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0053  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0079  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897328  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0071  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00351274  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0062  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0202562  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0052  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188618  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05583  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00137885  normal  0.131541 
 
 
-
 
NC_003295  RS05732  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705135  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_003296  RS05381  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0141064  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0035  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0034  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0293372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0025  tRNA-Thr  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000411074  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0049  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106855  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0093  tRNA-Val  86 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0026  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000991337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0009  tRNA-Val  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000243389  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0057  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.700226  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0024  tRNA-Val  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>