More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05583 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RS00235  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00686486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05583  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00137885  normal  0.131541 
 
 
-
 
NC_003295  RS05732  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705135  normal  0.420987 
 
 
-
 
NC_003296  RS05381  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0141064  normal  0.0944899 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0052  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188618  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0062  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0202562  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0071  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00351274  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0079  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0044  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0237492  normal  0.0570511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0063  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000469016  normal  0.343249 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0047  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0069  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0826408  hitchhiker  0.0022549 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0058  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00611811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0054  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000352314  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0053  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0063  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0071  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00796346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0076  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0027  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0579561  normal  0.867818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0005  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125114  hitchhiker  0.00000268461 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0003  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000227262  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0003  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000155812  hitchhiker  0.0000000064789 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0052  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126724  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0057  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0003  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212749  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0056  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00769688  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0029  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.856201  normal  0.110623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0043  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.077359  normal  0.13157 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0007  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000510908  normal  0.912262 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0592  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000232315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0451  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000861807  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0630  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000358951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3771  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000362493  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0015  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218545  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0495  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328394  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1338  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1897  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000326046  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0004  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000259664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0064  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00102646  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_R0080  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161915  normal  0.0753371 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000192753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000169061  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0007  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0002  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000350772  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0080  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000523506  normal  0.960372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0009  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0789863  normal  0.0348926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0014  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206822  hitchhiker  0.00501521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0003  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281638  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0019  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.47791e-17  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0028  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.79359e-16  unclonable  0.0000000519996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0040  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0041  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0010  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.885368  normal  0.217926 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0004  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000586808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1474  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000230353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3561  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000191546  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1909  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0061  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3108  tRNA-OTHER  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0002  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1168  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0008  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000057539  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0904  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0066867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3541  tRNA-OTHER  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00194586  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2046  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000148192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1097  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000222375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2897  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3094  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516421  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0017  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.853274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0092  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0005  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000238444  hitchhiker  0.00232572 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0068  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00409998  normal  0.989602 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_R0086  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00192054  normal  0.222776 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0018  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000206561  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0066  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0054  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0435849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0039  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000372994  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0054  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0065  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00130991  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0072  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00108328  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0084  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011536  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0928  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000151896  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0701  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000189505  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0008  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000162248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0018  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000054904  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0051  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0066  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000013609  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0083  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000284492  normal  0.0190641 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0089  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000671858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0008  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000320674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0017  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000962066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0064  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0080  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000338502  normal  0.0447756 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0083  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00594726  hitchhiker  0.00848998 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3542  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000176081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1329  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00168049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1988  tRNA-OTHER  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000295907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3832  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406372  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3568  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0990712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>