More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2382 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_1692  hypothetical protein  64.39 
 
 		 645 aa  869    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1731  hypothetical protein  64.39 
 
 		 645 aa  869    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000833443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1470  hypothetical protein  64.39 
 
 		 645 aa  869    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1442  ATP-dependent helicase DinG  64.54 
 
 		 645 aa  870    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1443  ATP-dependent helicase DinG  64.54 
 
 		 645 aa  871    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1619  hypothetical protein  64.54 
 
 		 645 aa  872    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1586  hypothetical protein  64.39 
 
 		 645 aa  869    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1300  helicase c2  64.63 
 
 		 645 aa  870    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2382  helicase c2  100 
 
 		 653 aa  1346    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1902  helicase c2  85.76 
 
 		 646 aa  1155    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1656  hypothetical protein  64.54 
 
 		 645 aa  870    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.10694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1486  helicase c2  64.48 
 
 		 645 aa  863    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.530371  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3725  hypothetical protein  64.7 
 
 		 645 aa  874    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0167806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1991  helicase c2  38.16 
 
 		 657 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0246396  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1544  helicase c2  37.1 
 
 		 635 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0592026  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  29.27 
 
 		 643 aa  196  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  28.43 
 
 		 838 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.5 
 
 		 929 aa  195  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  25.66 
 
 		 832 aa  194  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  30.14 
 
 		 674 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  28.94 
 
 		 650 aa  189  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  28.94 
 
 		 650 aa  188  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  28.71 
 
 		 633 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  29.19 
 
 		 633 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.84 
 
 		 934 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.65 
 
 		 934 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  27.87 
 
 		 661 aa  185  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.65 
 
 		 934 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.64 
 
 		 934 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.23 
 
 		 927 aa  184  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.78 
 
 		 956 aa  183  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  28.32 
 
 		 636 aa  182  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.31 
 
 		 934 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.46 
 
 		 934 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.54 
 
 		 934 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.5 
 
 		 934 aa  181  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.5 
 
 		 934 aa  181  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.5 
 
 		 934 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  28.04 
 
 		 659 aa  180  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.2 
 
 		 944 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  27.66 
 
 		 765 aa  178  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  27.58 
 
 		 646 aa  178  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  25.34 
 
 		 667 aa  178  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  26.45 
 
 		 729 aa  177  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  27.02 
 
 		 660 aa  176  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  26.53 
 
 		 646 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.25 
 
 		 934 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  26.94 
 
 		 658 aa  173  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  27.61 
 
 		 652 aa  173  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  27.27 
 
 		 652 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  26.61 
 
 		 653 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  26.32 
 
 		 646 aa  170  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  27.87 
 
 		 647 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  26.58 
 
 		 646 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  26.67 
 
 		 644 aa  168  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  26.08 
 
 		 651 aa  167  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  25.16 
 
 		 668 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  26.68 
 
 		 665 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  26.83 
 
 		 665 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  26.78 
 
 		 640 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  26.83 
 
 		 665 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.81 
 
 		 952 aa  165  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  28.03 
 
 		 676 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  26.92 
 
 		 675 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  26.11 
 
 		 681 aa  164  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  26.78 
 
 		 669 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  26.5 
 
 		 840 aa  163  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  26.62 
 
 		 669 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  26.62 
 
 		 640 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  26.81 
 
 		 636 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  26.81 
 
 		 636 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  26.81 
 
 		 636 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  26.81 
 
 		 636 aa  162  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  27.14 
 
 		 634 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  26.28 
 
 		 636 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  27.56 
 
 		 640 aa  162  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  26.9 
 
 		 670 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  25.18 
 
 		 672 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  26.81 
 
 		 636 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  26.81 
 
 		 636 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  26.65 
 
 		 636 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  26.65 
 
 		 636 aa  160  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  28.01 
 
 		 664 aa  160  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  26.48 
 
 		 683 aa  160  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  26.92 
 
 		 876 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  26.33 
 
 		 707 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  26.76 
 
 		 699 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  26.12 
 
 		 636 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  26.06 
 
 		 639 aa  159  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  26.12 
 
 		 636 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  26.32 
 
 		 636 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  26.65 
 
 		 636 aa  159  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  26.33 
 
 		 645 aa  158  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.66 
 
 		 666 aa  157  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.46 
 
 		 921 aa  157  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.38 
 
 		 921 aa  157  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  25.86 
 
 		 843 aa  156  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  25.96 
 
 		 639 aa  156  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  26.63 
 
 		 640 aa  156  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  25.96 
 
 		 636 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>