180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1906 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  78.16 
 
 		 89 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  64.29 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  64.29 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  64.29 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  64.29 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  64.29 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  61.9 
 
 		 87 aa  114  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  64.29 
 
 		 87 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  63.1 
 
 		 87 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  63.1 
 
 		 87 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  64.29 
 
 		 87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  60.71 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  42.17 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  50 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  45 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  42.68 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  44.05 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  46.43 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1249  hypothetical protein  48.15 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1274  hypothetical protein  48.15 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000722021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  46.58 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  45.59 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  44.71 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  41.03 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  36.36 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  45.68 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  45.83 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  41.89 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  39.68 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  37.66 
 
 		 86 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  39.68 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  47.3 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  41.27 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  42.86 
 
 		 197 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  36.71 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  46.15 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  41.27 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  41.27 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  36.11 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2059  hypothetical protein  39.76 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0482  YGGT family protein  39.76 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  43.66 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  43.66 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09420  YGGT family protein  43.33 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0374287  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1141  cell division membrane protein  47.46 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  38.03 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  36.99 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0014  hypothetical protein  33.85 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  40.3 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  39.71 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  40.3 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  40.3 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  40.3 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  45 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2785  hypothetical protein  44.12 
 
 		 193 aa  53.9  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.555098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  31.51 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  34.07 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  35.48 
 
 		 196 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41246  predicted protein  46.55 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0509332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  43.48 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  33.87 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  33.87 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  33.87 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3178  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.314791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  34.12 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  34.12 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0598  protein of unknown function YGGT  31.4 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192983  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0780  hypothetical protein  38.46 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0696156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  37.5 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  37.5 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0295  protein of unknown function YGGT  44.26 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 199 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  37.5 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  37.5 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  38.18 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3585  protein of unknown function YGGT  46.43 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2521  protein of unknown function YGGT  46.43 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2905  protein of unknown function YGGT  31.94 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.356059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3030  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  32.89 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0517  hypothetical protein  35.48 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0567252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  43.1 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10668  predicted protein  41.07 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.605369 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  38.71 
 
 		 189 aa  47  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  38.24 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  37.33 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  33.72 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  36.62 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  36.62 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  36.62 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3264  YGGT family protein  36.11 
 
 		 188 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  36.62 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  36.62 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  36.62 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>