50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1187 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
169 aa  345  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  84.24 
 
 
165 aa  301  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  58.79 
 
 
169 aa  200  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  57.74 
 
 
168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  51.52 
 
 
169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  53.61 
 
 
168 aa  179  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  52.17 
 
 
165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  50.31 
 
 
163 aa  178  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  47.31 
 
 
185 aa  174  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  49.7 
 
 
165 aa  167  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  45.96 
 
 
177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  49.4 
 
 
170 aa  164  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  46.58 
 
 
162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.21 
 
 
178 aa  154  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  47.53 
 
 
168 aa  151  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.46 
 
 
170 aa  144  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  37.89 
 
 
199 aa  121  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  34.94 
 
 
169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  34.55 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.12 
 
 
199 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  36.31 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  38.41 
 
 
165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  36.59 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.26 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.78 
 
 
158 aa  108  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.86 
 
 
173 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.58 
 
 
165 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  36.81 
 
 
161 aa  102  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  36.42 
 
 
189 aa  101  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  40.24 
 
 
192 aa  100  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  35.54 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  35.33 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.16 
 
 
172 aa  94.4  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  33.54 
 
 
162 aa  94.4  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  34.15 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  37.8 
 
 
167 aa  91.7  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  31.84 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.93 
 
 
177 aa  89.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  33.13 
 
 
162 aa  89  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  32.32 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  33.13 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  27.44 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  36.09 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  38.18 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.34 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  23.67 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  26.2 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  20.86 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  24.44 
 
 
190 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  28.36 
 
 
190 aa  40.8  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>