250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0892 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  100 
 
 
251 aa  484  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  72.84 
 
 
248 aa  352  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  41.99 
 
 
240 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1221  peptidase A24A domain-containing protein  41.23 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.544367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1419  late competence protein comC  40.17 
 
 
240 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1357  late competence protein comC  40.61 
 
 
240 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1199  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  38.86 
 
 
240 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3987  late competence protein comC  40.17 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1459  late competence protein comC  40.61 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  40.73 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1197  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  38.86 
 
 
240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1219  late competence protein comC  38.43 
 
 
240 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1318  late competence protein comC  38.43 
 
 
240 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1395  late competence protein comC  38.43 
 
 
240 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.46 
 
 
247 aa  155  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.47 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  37.05 
 
 
252 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  38.74 
 
 
248 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  36.86 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  36.96 
 
 
274 aa  145  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  40.08 
 
 
266 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  40.08 
 
 
266 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  37.55 
 
 
259 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  38.14 
 
 
246 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  35.08 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  35.54 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.33 
 
 
259 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.64 
 
 
293 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  40.49 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  35.68 
 
 
255 aa  139  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  37.35 
 
 
259 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0311  peptidase A24A domain protein  40.16 
 
 
261 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  36.51 
 
 
253 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  38.91 
 
 
283 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  36.4 
 
 
258 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.33 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  29.48 
 
 
265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.6 
 
 
293 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0967  peptidase A24A domain-containing protein  42.11 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0417155  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  38.67 
 
 
254 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  38.6 
 
 
293 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  35.13 
 
 
288 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  37.55 
 
 
261 aa  132  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  34.69 
 
 
290 aa  129  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  34.96 
 
 
304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  35.4 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2090  peptidase A24A domain protein  35.44 
 
 
245 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  34.55 
 
 
255 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  34.96 
 
 
308 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  33.33 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  34.68 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  31.97 
 
 
247 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  34.96 
 
 
304 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  31.56 
 
 
247 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4659  peptidase A24A domain protein  34.1 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000165962 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  32.68 
 
 
263 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  33.04 
 
 
303 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  29.37 
 
 
300 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  33.21 
 
 
290 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  32.96 
 
 
286 aa  121  8e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.32 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2579  peptidase A24A domain protein  35.34 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.691194 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  34.16 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  37.9 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  34.8 
 
 
290 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2819  peptidase A24A domain-containing protein  35.37 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194344  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  35.5 
 
 
289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.4 
 
 
308 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.84 
 
 
308 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  32.79 
 
 
287 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  35.02 
 
 
260 aa  118  7e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  34.07 
 
 
296 aa  118  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.4 
 
 
309 aa  119  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.03 
 
 
299 aa  118  7.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  33.33 
 
 
289 aa  118  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  31.54 
 
 
288 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.06 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  39.17 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  32.21 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  32.46 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  32.38 
 
 
287 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.28 
 
 
297 aa  115  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  32.44 
 
 
291 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  38.49 
 
 
250 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  34.65 
 
 
308 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  31.9 
 
 
288 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  36.44 
 
 
303 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  35.56 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  35.65 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  32.95 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  32.95 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  31.99 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  35.22 
 
 
287 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  31.99 
 
 
288 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.22 
 
 
283 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  34.18 
 
 
309 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  34.36 
 
 
302 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0310  prepilin peptidase  35.53 
 
 
288 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  33.19 
 
 
308 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.16 
 
 
280 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>