More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3119 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3119  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  753    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1176  alanine dehydrogenase  95.41 
 
 		 371 aa  697    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  71.08 
 
 		 370 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1485  alanine dehydrogenase  70.27 
 
 		 370 aa  530  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775902  hitchhiker  0.0000000116767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2154  alanine dehydrogenase  70.62 
 
 		 371 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1553  L-alanine dehydrogenase  72.16 
 
 		 370 aa  481  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.354351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2381  alanine dehydrogenase  69.46 
 
 		 370 aa  481  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0319294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  59.57 
 
 		 376 aa  458  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  58.92 
 
 		 370 aa  448  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1134  alanine dehydrogenase  64.96 
 
 		 371 aa  449  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  59.07 
 
 		 372 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0517  alanine dehydrogenase  63.78 
 
 		 369 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0594266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  59.45 
 
 		 373 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  56.32 
 
 		 366 aa  406  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  57.57 
 
 		 370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  53.51 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  53.1 
 
 		 371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  55.8 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  51.75 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 		 373 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  55.41 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  57.03 
 
 		 371 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  53.17 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  53.91 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 		 377 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  54.82 
 
 		 372 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  52.16 
 
 		 372 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  53.55 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  52.29 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  52.29 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  52.99 
 
 		 376 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  53.37 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  54.18 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  53.85 
 
 		 371 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  53.85 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  53.85 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  53.85 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  53.85 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  53.85 
 
 		 371 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  55.95 
 
 		 371 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  53.85 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  53.85 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  54.99 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  53.85 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  54.12 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  52.83 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  53.85 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  52.29 
 
 		 374 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  55.95 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  53.57 
 
 		 377 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  53.57 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  53.3 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4146  alanine dehydrogenase  55.95 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110875  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  55.95 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4220  alanine dehydrogenase  55.68 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.757032  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  53.3 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  55.96 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  55.68 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  53.02 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  53.02 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  53.02 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3106  alanine dehydrogenase  51.61 
 
 		 373 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  52.16 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  55.91 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  55.04 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  55.65 
 
 		 373 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  50.81 
 
 		 373 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1168  L-alanine dehydrogenase  55.41 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4385  alanine dehydrogenase  56.49 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  53.2 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  51.62 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  49.31 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5117  alanine dehydrogenase  53.99 
 
 		 374 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.564204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  53.19 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  54.27 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  51.09 
 
 		 390 aa  364  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  51.62 
 
 		 371 aa  365  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0922  alanine dehydrogenase  57.07 
 
 		 371 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  52.97 
 
 		 371 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  50.81 
 
 		 371 aa  361  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  55.4 
 
 		 374 aa  361  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  55.68 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  53.72 
 
 		 371 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1216  alanine dehydrogenase  52.16 
 
 		 369 aa  360  3e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.605353  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  55.65 
 
 		 374 aa  358  6e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1261  alanine dehydrogenase  51.89 
 
 		 369 aa  358  8e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1536  alanine dehydrogenase  56.25 
 
 		 371 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390556  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0039  alanine dehydrogenase  56.25 
 
 		 371 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1449  alanine dehydrogenase  56.25 
 
 		 371 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.283276  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  53.17 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  50.27 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2125  alanine dehydrogenase  52.62 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  normal  0.0430396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>