32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1424 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  100 
 
 		 386 aa  776    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  35.57 
 
 		 391 aa  179  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  36.39 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  31.65 
 
 		 384 aa  159  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  37.06 
 
 		 489 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  35.27 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  37.75 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  38.8 
 
 		 392 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  36.22 
 
 		 833 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  41.39 
 
 		 358 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  44.68 
 
 		 288 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  34.84 
 
 		 388 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  43.01 
 
 		 353 aa  109  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  30.74 
 
 		 468 aa  99.8  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0790  hypothetical protein  27.85 
 
 		 399 aa  99.4  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  30.1 
 
 		 516 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  31.43 
 
 		 428 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  44.83 
 
 		 260 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  31.32 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4330  extracellular HAF  31.85 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2344  HAF family protein  25.81 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.734179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  28.75 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  36.39 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  29.08 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4159  hypothetical protein  32.41 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.606024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1923  hypothetical protein  25.45 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4016  hypothetical protein  25.66 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.385187  normal  0.416112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3240  hypothetical protein  24.68 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0144295 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  29.06 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  36.51 
 
 		 2169 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3556  hypothetical protein  38.96 
 
 		 353 aa  49.7  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1182  hypothetical protein  32.86 
 
 		 71 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.527432  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>