14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3240 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3240  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  707    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0144295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3556  hypothetical protein  41.1 
 
 
353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0032  hypothetical protein  32.11 
 
 
681 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2809  hypothetical protein  29.17 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.830313  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4027  hypothetical protein  26.3 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354073  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2010  hypothetical protein  27.88 
 
 
354 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119829  normal  0.0755909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0919  hypothetical protein  29.22 
 
 
386 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316329  normal  0.420738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  25.24 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3711  hypothetical protein  25.45 
 
 
375 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  28.57 
 
 
833 aa  46.2  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  25.54 
 
 
489 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  26.38 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4159  hypothetical protein  38.57 
 
 
312 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.606024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  27.15 
 
 
388 aa  43.1  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>