More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0252 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  94.9 
 
 		 353 aa  690    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 		 353 aa  720    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  52.84 
 
 		 355 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  53.85 
 
 		 365 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  51.57 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  53.28 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  50.57 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  50.14 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.57 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.15 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.43 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.29 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.86 
 
 		 356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.42 
 
 		 354 aa  352  5.9999999999999994e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.71 
 
 		 353 aa  348  6e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.58 
 
 		 341 aa  347  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.31 
 
 		 351 aa  347  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.01 
 
 		 351 aa  347  3e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.7 
 
 		 354 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.87 
 
 		 355 aa  332  6e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.45 
 
 		 354 aa  330  2e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.17 
 
 		 372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.17 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.29 
 
 		 374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.09 
 
 		 547 aa  325  7e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  43.1 
 
 		 363 aa  324  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  43.63 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  41.88 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.44 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  45.58 
 
 		 380 aa  311  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  43.44 
 
 		 375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.74 
 
 		 375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.35 
 
 		 385 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.35 
 
 		 385 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.66 
 
 		 376 aa  296  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.49 
 
 		 387 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.18 
 
 		 379 aa  295  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.81 
 
 		 355 aa  290  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  43.33 
 
 		 354 aa  288  8e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.08 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  40.39 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.24 
 
 		 362 aa  280  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.36 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.32 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  39.26 
 
 		 354 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  38.97 
 
 		 354 aa  263  4e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.75 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.68 
 
 		 348 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.46 
 
 		 352 aa  262  6e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.71 
 
 		 395 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.89 
 
 		 352 aa  259  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.33 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.33 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.42 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.76 
 
 		 360 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.57 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.39 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.67 
 
 		 368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.42 
 
 		 374 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  40 
 
 		 332 aa  250  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.35 
 
 		 372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.03 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.57 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.25 
 
 		 327 aa  228  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.07 
 
 		 387 aa  226  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.28 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.14 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.52 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.73 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.33 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.36 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.66 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.92 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.25 
 
 		 291 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.7 
 
 		 333 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.68 
 
 		 325 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.14 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.11 
 
 		 357 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.7 
 
 		 322 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.97 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.44 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.44 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.44 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.86 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.08 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.08 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.76 
 
 		 325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  33.65 
 
 		 325 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.11 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.19 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2129  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.38 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0400102  normal  0.185773 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.9 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 		 316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.6 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  32.6 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  32.6 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  32.6 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.6 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2221  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.94 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.97 
 
 		 316 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>