More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6328 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6328  aminotransferase class I and II  100 
 
 
397 aa  789    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.657142  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  37.73 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  30.47 
 
 
393 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  31.2 
 
 
390 aa  196  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
386 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  31.68 
 
 
393 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  32.9 
 
 
393 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  33.8 
 
 
385 aa  186  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  32.27 
 
 
412 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  33.69 
 
 
394 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  29.64 
 
 
404 aa  183  6e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  35.67 
 
 
386 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  35.81 
 
 
391 aa  182  9.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  34.41 
 
 
391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  35.93 
 
 
393 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  32.51 
 
 
392 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2784  aminotransferase class I and II  36.34 
 
 
421 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  32.86 
 
 
386 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  32.59 
 
 
391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  29.48 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  29.75 
 
 
393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  32.8 
 
 
383 aa  173  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  35.16 
 
 
386 aa  173  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  29.48 
 
 
393 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  32.37 
 
 
409 aa  172  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  35.41 
 
 
385 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
386 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  31.09 
 
 
401 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  33.97 
 
 
390 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  30.85 
 
 
397 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  30.58 
 
 
400 aa  170  5e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  31.23 
 
 
514 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  32.87 
 
 
392 aa  170  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  29.19 
 
 
397 aa  169  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  26.27 
 
 
397 aa  169  8e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  31.09 
 
 
521 aa  169  8e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  28.89 
 
 
372 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10075  aminotransferase  34.73 
 
 
390 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.8846  normal  0.0279685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2586  aminotransferase, class I and II  35.68 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  34.95 
 
 
405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2428  aminotransferase class I and II  36.07 
 
 
370 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  28.77 
 
 
387 aa  167  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  29.13 
 
 
384 aa  166  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  28.53 
 
 
386 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  29.1 
 
 
389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  33.06 
 
 
390 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  34.7 
 
 
394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  31.48 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  32.08 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12317  aminotransferase  33.42 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  29.06 
 
 
383 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  34.09 
 
 
385 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  34.09 
 
 
385 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  32.5 
 
 
390 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  34.17 
 
 
386 aa  162  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  30.99 
 
 
400 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  30.99 
 
 
400 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  30.99 
 
 
400 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  30.99 
 
 
400 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  33.88 
 
 
381 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  33.52 
 
 
396 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  30.88 
 
 
395 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  35.2 
 
 
399 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  30.66 
 
 
379 aa  160  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  30.73 
 
 
392 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  30.73 
 
 
392 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  30.7 
 
 
400 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  27.81 
 
 
383 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  28.49 
 
 
389 aa  159  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  33.11 
 
 
390 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  33.05 
 
 
383 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  29.2 
 
 
393 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  28.57 
 
 
390 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  31.68 
 
 
393 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  26.39 
 
 
399 aa  157  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  31.94 
 
 
383 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  29.28 
 
 
390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  28.61 
 
 
387 aa  156  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  32.29 
 
 
395 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  31.28 
 
 
390 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  26.78 
 
 
383 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  27.76 
 
 
383 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  27.73 
 
 
394 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  28.76 
 
 
394 aa  154  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  26.5 
 
 
383 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  30.87 
 
 
392 aa  153  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  31.83 
 
 
402 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  26.5 
 
 
383 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  26.78 
 
 
383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  26.5 
 
 
383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  26.5 
 
 
383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  30.11 
 
 
390 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  29.3 
 
 
387 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  33.69 
 
 
390 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  26.21 
 
 
383 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  26.21 
 
 
383 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  30.45 
 
 
375 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  26.5 
 
 
383 aa  150  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  30.7 
 
 
400 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>