More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5930 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  100 
 
 
483 aa  952    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  86.59 
 
 
493 aa  828    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  64.56 
 
 
463 aa  568  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  62.66 
 
 
479 aa  566  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.68 
 
 
464 aa  559  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  64.04 
 
 
460 aa  558  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  63.19 
 
 
481 aa  557  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  62.34 
 
 
460 aa  537  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  61.67 
 
 
467 aa  538  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  61.33 
 
 
470 aa  537  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  62.61 
 
 
491 aa  523  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  61.02 
 
 
465 aa  522  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  63.31 
 
 
463 aa  520  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  58.56 
 
 
467 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  62.09 
 
 
467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  58.47 
 
 
467 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  57.91 
 
 
467 aa  514  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  58.14 
 
 
491 aa  501  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  57.44 
 
 
468 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  59.65 
 
 
471 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  58.39 
 
 
468 aa  491  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  57.44 
 
 
463 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  61.08 
 
 
495 aa  487  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  62.71 
 
 
480 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  58.68 
 
 
467 aa  488  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  55.37 
 
 
476 aa  484  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  56.78 
 
 
471 aa  484  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  56.94 
 
 
470 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  55.44 
 
 
471 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  57.14 
 
 
470 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  57.14 
 
 
470 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  56.06 
 
 
495 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  55.65 
 
 
471 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  58.42 
 
 
506 aa  476  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  56.14 
 
 
478 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  56.38 
 
 
478 aa  442  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.69 
 
 
458 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.22 
 
 
470 aa  243  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.56 
 
 
458 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.16 
 
 
470 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.25 
 
 
459 aa  230  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.67 
 
 
471 aa  226  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.41 
 
 
460 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.59 
 
 
470 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.19 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.88 
 
 
465 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.12 
 
 
473 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.64 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.64 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.42 
 
 
465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.48 
 
 
473 aa  221  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.9 
 
 
474 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.43 
 
 
459 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.49 
 
 
465 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.92 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.77 
 
 
469 aa  216  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.88 
 
 
466 aa  216  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.03 
 
 
468 aa  216  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.6 
 
 
468 aa  216  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.51 
 
 
467 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  32.77 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.61 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.51 
 
 
470 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.51 
 
 
470 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.02 
 
 
463 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.67 
 
 
470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.51 
 
 
470 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.51 
 
 
470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.08 
 
 
470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.51 
 
 
470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.77 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.51 
 
 
470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.4 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.71 
 
 
459 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.08 
 
 
470 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.08 
 
 
470 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.08 
 
 
470 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 
484 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.39 
 
 
468 aa  213  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
484 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.39 
 
 
468 aa  213  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 
484 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.96 
 
 
562 aa  213  9e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.95 
 
 
471 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.32 
 
 
465 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 
471 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.47 
 
 
465 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.36 
 
 
459 aa  212  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.21 
 
 
465 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.85 
 
 
463 aa  211  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.87 
 
 
470 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.85 
 
 
464 aa  211  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.13 
 
 
465 aa  210  4e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.94 
 
 
462 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  29 
 
 
462 aa  210  6e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.88 
 
 
581 aa  209  7e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 
471 aa  209  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.06 
 
 
464 aa  209  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.28 
 
 
468 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.85 
 
 
459 aa  209  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>