43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5569 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  776    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  81.14 
 
 		 386 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  65.89 
 
 		 383 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  61.24 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  67.71 
 
 		 383 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  60.88 
 
 		 386 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  59.07 
 
 		 383 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  58.07 
 
 		 377 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  55.75 
 
 		 372 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0392  hypothetical protein  47.66 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1320  hypothetical protein  44.25 
 
 		 369 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  33.41 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  33.17 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3375  protein of unknown function DUF839  31.04 
 
 		 435 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2727  protein of unknown function DUF839  30.39 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34209  predicted protein  32.43 
 
 		 455 aa  136  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4197  hypothetical protein  34.3 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.017102  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34208  predicted protein  31.83 
 
 		 587 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  30.71 
 
 		 471 aa  131  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  29.3 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  26.76 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1243  hypothetical protein  27.47 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0271977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  29.06 
 
 		 458 aa  113  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2607  twin-arginine translocation pathway signal  30.16 
 
 		 484 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3405  twin-arginine translocation pathway signal  27.98 
 
 		 504 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.990674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34273  predicted protein  29.7 
 
 		 630 aa  105  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.842381  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2869  protein of unknown function DUF839  30.67 
 
 		 499 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  27.49 
 
 		 494 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  26.32 
 
 		 560 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1423  putative phosphatase  23.3 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.100323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  31.58 
 
 		 631 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  25.56 
 
 		 739 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  25.45 
 
 		 624 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  24.77 
 
 		 612 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  33.6 
 
 		 587 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  27.27 
 
 		 607 aa  49.7  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  25 
 
 		 625 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  27.27 
 
 		 630 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  22.35 
 
 		 593 aa  47  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  22.73 
 
 		 593 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  21.43 
 
 		 593 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  26.77 
 
 		 674 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  26.87 
 
 		 693 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>