More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4594 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
306 aa  594  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4340  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
280 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0293254  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
285 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3000  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0641388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
278 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130127 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
277 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0215  short chain dehydrogenase  31.54 
 
 
275 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1001  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 
301 aa  106  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
279 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.288274  normal  0.29741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 
277 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18450  short chain dehydrogenase  28.67 
 
 
279 aa  97.4  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0882393  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
280 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439013  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
266 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.64422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5231  short chain dehydrogenase  31.5 
 
 
252 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0476444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3615  putative dehydrogenase  31.45 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.427411  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0249  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.02 
 
 
258 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0279472  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
255 aa  89.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 
254 aa  89.4  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
252 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.57 
 
 
251 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
249 aa  86.7  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 
258 aa  85.9  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0291  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.45 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.37 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
255 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00568978  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.87 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  26.86 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19640  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  31.86 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305242  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3786  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.56 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71727  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3782  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.56 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3855  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.56 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1839  glucose 1-dehydrogenase  24.82 
 
 
263 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0372378  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.67 
 
 
249 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
205 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.47 
 
 
246 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  29.33 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  29.33 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0720968  normal  0.127644 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2773  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.42 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1148  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.42 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  28.42 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2928  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.42 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458345  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5253  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.82 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0368  glucose-1-dehydrogenase  28.52 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0342914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  28.62 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877905  normal  0.0437007 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  28.62 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1512  short chain dehydrogenase  29.86 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538743  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  27.92 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  31 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  32.19 
 
 
516 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  28.07 
 
 
247 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.81 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  27.02 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.72 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  28.32 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0631  acetoacetyl-CoA reductase  26.69 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  28.47 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.42 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  26.22 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  27.57 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  26.22 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3534  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase  26.33 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000174886  normal  0.399546 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  32.38 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6250  short chain dehydrogenase  31.32 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.37 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
275 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  28.77 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256895  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  27.27 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0167  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.11 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000024572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.35 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04691  D-arabinitol dehydrogenase (EC 1.1.1.250) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T5L8]  30.7 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  28.27 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.11 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  28.27 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.42 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.73 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.21 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>