53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2409 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  93.94 
 
 		 462 aa  848    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  93.94 
 
 		 462 aa  848    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  93.94 
 
 		 462 aa  848    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 462 aa  913    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  93.94 
 
 		 462 aa  848    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  64.98 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  64.98 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  62.77 
 
 		 465 aa  552  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  62.77 
 
 		 465 aa  552  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  62.99 
 
 		 465 aa  552  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  62.77 
 
 		 465 aa  552  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  64.98 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  62.77 
 
 		 465 aa  552  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  62.77 
 
 		 465 aa  552  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  62.77 
 
 		 465 aa  552  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  64.13 
 
 		 465 aa  546  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  63.68 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  54.79 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  54.79 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  54.79 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  41.38 
 
 		 473 aa  280  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0570  hypothetical protein  44.07 
 
 		 385 aa  270  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  41.23 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  41.23 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  41.23 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  41.23 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  40.47 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  40.47 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  41.23 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  41.23 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  41.23 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3012  hypothetical protein  71.43 
 
 		 243 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0739  hypothetical protein  57.84 
 
 		 189 aa  117  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3087  hypothetical protein  61.7 
 
 		 127 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0760419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  29.61 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  30.38 
 
 		 456 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3052  hypothetical protein  80.49 
 
 		 114 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4493  hypothetical protein  36.69 
 
 		 162 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  24.73 
 
 		 482 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  24.73 
 
 		 482 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  24.73 
 
 		 482 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  24.33 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  24.33 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  23.92 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3758  transposase, IS4 family protein  22.77 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2354  transposase, IS4 family protein  22.77 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2028  transposase, IS4 family protein  22.77 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0133  transposase, IS4 family protein  22.77 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0302843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3756  transposase, IS4 family protein  22.77 
 
 		 397 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  25.85 
 
 		 458 aa  50.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  25.85 
 
 		 458 aa  50.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4308  transposase, IS4  29.51 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661082  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0983  transposase, IS4 family protein  24.12 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>