238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2098 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  63.65 
 
 		 518 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  1056    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  68.6 
 
 		 544 aa  658    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  67.82 
 
 		 567 aa  639    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  63.85 
 
 		 520 aa  651    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  67.82 
 
 		 567 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  68.17 
 
 		 519 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  67.6 
 
 		 606 aa  637    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  66.8 
 
 		 553 aa  660    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  67.82 
 
 		 567 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  66.52 
 
 		 551 aa  630  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2799  protein of unknown function DUF404  63.98 
 
 		 553 aa  622  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4571  protein of unknown function DUF404  64.44 
 
 		 545 aa  615  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2221  protein of unknown function DUF404  65.09 
 
 		 526 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2205  protein of unknown function DUF404  68.83 
 
 		 544 aa  595  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320097  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  63.17 
 
 		 552 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  55.91 
 
 		 488 aa  518  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  56.44 
 
 		 476 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  56.32 
 
 		 476 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  58.39 
 
 		 539 aa  514  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  55.89 
 
 		 480 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  53.49 
 
 		 473 aa  498  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  51.61 
 
 		 487 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  52.15 
 
 		 482 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  51.92 
 
 		 486 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  50.95 
 
 		 482 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  51.18 
 
 		 470 aa  491  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  50.95 
 
 		 482 aa  489  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  53.3 
 
 		 472 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  51.59 
 
 		 498 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  50.11 
 
 		 482 aa  488  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  51.14 
 
 		 497 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  52.88 
 
 		 489 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  51.37 
 
 		 518 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  49.25 
 
 		 481 aa  482  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  50.31 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  51.28 
 
 		 482 aa  484  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  52.45 
 
 		 472 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  56.1 
 
 		 487 aa  485  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  55.28 
 
 		 518 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  55.88 
 
 		 487 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  52.15 
 
 		 482 aa  485  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  50.53 
 
 		 478 aa  481  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  50.11 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1312  protein of unknown function DUF404  51.5 
 
 		 480 aa  481  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  53.06 
 
 		 494 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  53 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  53.41 
 
 		 494 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2474  hypothetical protein  50.2 
 
 		 515 aa  478  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  52.74 
 
 		 476 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  53.6 
 
 		 488 aa  481  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  51.5 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1668  protein of unknown function DUF404  57.24 
 
 		 508 aa  481  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.325623  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  52.35 
 
 		 482 aa  475  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  52.97 
 
 		 507 aa  478  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  49.89 
 
 		 480 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  52.4 
 
 		 490 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  51.48 
 
 		 477 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  50.11 
 
 		 480 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  51.57 
 
 		 477 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  52.24 
 
 		 472 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  53.6 
 
 		 491 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1815  hypothetical protein  56.34 
 
 		 479 aa  475  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.02256  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  50.74 
 
 		 492 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  52.24 
 
 		 472 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  50.11 
 
 		 479 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  50.32 
 
 		 480 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  53.52 
 
 		 507 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0990  hypothetical protein  50.32 
 
 		 484 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1735  hypothetical protein  51.18 
 
 		 494 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  53.66 
 
 		 490 aa  474  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  51.72 
 
 		 488 aa  474  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  54.79 
 
 		 489 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  50.86 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  52.26 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  52.03 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  51.83 
 
 		 469 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  49.89 
 
 		 482 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2676  hypothetical protein  50.86 
 
 		 475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.508929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3576  hypothetical protein  52.26 
 
 		 470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183562  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  49.04 
 
 		 488 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  52.24 
 
 		 469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  50.64 
 
 		 477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2059  hypothetical protein  51.83 
 
 		 469 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  52.04 
 
 		 471 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3011  hypothetical protein  50.54 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  53 
 
 		 489 aa  467  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  52.78 
 
 		 497 aa  465  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  50.64 
 
 		 470 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0404  hypothetical protein  53.5 
 
 		 485 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1078  hypothetical protein  50.32 
 
 		 472 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  50.75 
 
 		 469 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2415  hypothetical protein  51.53 
 
 		 463 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  51.6 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  51.39 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  49.25 
 
 		 501 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  50.96 
 
 		 469 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3065  hypothetical protein  50.54 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4258  hypothetical protein  50 
 
 		 476 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  50.11 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>