More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4397 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  100 
 
 		 425 aa  849    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  89.18 
 
 		 425 aa  764    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  66.43 
 
 		 418 aa  557  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  66.83 
 
 		 429 aa  534  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  66.5 
 
 		 428 aa  528  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  64.63 
 
 		 439 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  64.22 
 
 		 428 aa  520  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  63.05 
 
 		 429 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  66.26 
 
 		 428 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  65.76 
 
 		 413 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  62.96 
 
 		 416 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  61.58 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  64.03 
 
 		 421 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  63.99 
 
 		 418 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  61.15 
 
 		 416 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  62.22 
 
 		 424 aa  482  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  64.11 
 
 		 420 aa  480  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  59.85 
 
 		 414 aa  477  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  57.86 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  57.96 
 
 		 437 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  57.86 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  56.12 
 
 		 454 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  55.77 
 
 		 437 aa  457  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  56.97 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  55.21 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  56.68 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  54.14 
 
 		 412 aa  443  1e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  55.31 
 
 		 408 aa  444  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  58.42 
 
 		 411 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  54.9 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  52.59 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  42.45 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  37.66 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  37.41 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  37.91 
 
 		 403 aa  273  6e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  37.66 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  36.94 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  37.16 
 
 		 414 aa  252  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  35.06 
 
 		 405 aa  244  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  38.56 
 
 		 401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  33.91 
 
 		 416 aa  235  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  37.06 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  32.75 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  35.82 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  35.07 
 
 		 401 aa  219  8.999999999999998e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  33.91 
 
 		 402 aa  217  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  34.57 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  35.75 
 
 		 441 aa  207  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  36.72 
 
 		 402 aa  202  7e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  36.43 
 
 		 422 aa  200  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  34.56 
 
 		 396 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  34.69 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  33.25 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  33.95 
 
 		 403 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  41.99 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  35.09 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  35.81 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  35.61 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  41.52 
 
 		 346 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  33.51 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  36.87 
 
 		 351 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  40.32 
 
 		 351 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  33.92 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  29.97 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.93 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  36.2 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  36.2 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  40.52 
 
 		 355 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  35.5 
 
 		 351 aa  176  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  36.34 
 
 		 352 aa  176  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  35.33 
 
 		 348 aa  176  8e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  36.24 
 
 		 404 aa  176  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  34.49 
 
 		 368 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  32.38 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  35.06 
 
 		 348 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  29.5 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  33.52 
 
 		 346 aa  172  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  35.14 
 
 		 348 aa  172  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  37.65 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  33.99 
 
 		 371 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  35.82 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  36.04 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  35.95 
 
 		 352 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  35.95 
 
 		 352 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  35.42 
 
 		 349 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  37.26 
 
 		 354 aa  170  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  35.95 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  35.95 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  35.95 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  35.96 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  38.69 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  36.25 
 
 		 352 aa  170  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  35.33 
 
 		 356 aa  170  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  34.95 
 
 		 397 aa  170  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  39.82 
 
 		 361 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  32.93 
 
 		 351 aa  169  7e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  31.82 
 
 		 354 aa  169  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  35.65 
 
 		 352 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  38.22 
 
 		 352 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  38.11 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>