More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3998 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1109  transposase, IS4  100 
 
 		 278 aa  476  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138434  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2037  transposase, IS4  100 
 
 		 278 aa  476  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2540  transposase, IS4  100 
 
 		 278 aa  476  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2707  transposase, IS4  100 
 
 		 278 aa  476  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3998  transposase, IS4  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4006  transposase, IS4  100 
 
 		 278 aa  476  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2080  transposase, IS4  99.58 
 
 		 278 aa  473  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.382451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  54.47 
 
 		 287 aa  262  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  54.47 
 
 		 287 aa  262  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  54.47 
 
 		 287 aa  262  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  54.01 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  54.01 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  54.47 
 
 		 279 aa  262  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  52.79 
 
 		 283 aa  249  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1950  transposase, IS4 family protein  58.33 
 
 		 206 aa  236  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  45.54 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0457  insertion element transposase  52 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  44.69 
 
 		 275 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  41.88 
 
 		 278 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  43.72 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  43.72 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  43.72 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  43.36 
 
 		 274 aa  158  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  39.73 
 
 		 270 aa  158  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  40.89 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  40.44 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  40.44 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  40.44 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  41.33 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  40 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  39.56 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  40.44 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  40.44 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  39.56 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  39.56 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  39.56 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  39.56 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  39.56 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  39.56 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  39.56 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  39.56 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  39.56 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  39.56 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  39.56 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  37.93 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  40.36 
 
 		 298 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  39.18 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  37.95 
 
 		 265 aa  144  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  39.11 
 
 		 274 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  40 
 
 		 274 aa  142  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  43.09 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  42.86 
 
 		 274 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3747  transposase IS4 family protein  34.67 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  37.17 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  37.17 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  37.17 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  37.17 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  37.17 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  37.17 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  37.17 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  37.17 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  37.17 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  37.17 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  37.17 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  37.17 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  37.17 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  37.17 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  40 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  40 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  40 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  40 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  40 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  40 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2390  transposase IS4 family protein  41.12 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  40 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  40 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  44.15 
 
 		 274 aa  141  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  37.19 
 
 		 280 aa  141  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  38.26 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  40.27 
 
 		 275 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  38.39 
 
 		 270 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  39.47 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.402428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>