232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2468 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2310  carbon starvation protein CstA  56.12 
 
 		 753 aa  779    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265591  hitchhiker  0.00199124 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  53.76 
 
 		 701 aa  708    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  55.71 
 
 		 753 aa  741    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1938  carbon starvation protein CstA  64.21 
 
 		 738 aa  915    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.121526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  53.9 
 
 		 688 aa  702    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  54.42 
 
 		 688 aa  728    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  54.36 
 
 		 691 aa  726    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  55.74 
 
 		 686 aa  759    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5545  carbon starvation protein A  55.67 
 
 		 691 aa  687    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  57.01 
 
 		 688 aa  728    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41010  Carbon starvation protein  54.72 
 
 		 685 aa  652    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.425566  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4167  carbon starvation protein CstA  68.89 
 
 		 742 aa  940    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  52.41 
 
 		 691 aa  687    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  53.2 
 
 		 688 aa  703    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5269  carbon starvation protein A  55.96 
 
 		 691 aa  690    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  51.52 
 
 		 688 aa  722    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5096  carbon starvation protein A  55.96 
 
 		 691 aa  690    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0266106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5113  carbon starvation protein A  56.11 
 
 		 691 aa  690    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  52.67 
 
 		 691 aa  693    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1363  carbon starvation protein CstA  54.64 
 
 		 705 aa  679    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2987  carbon starvation protein CstA  52.28 
 
 		 693 aa  669    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0436073 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  52.16 
 
 		 687 aa  708    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  54.56 
 
 		 690 aa  733    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  56.82 
 
 		 692 aa  735    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  54.29 
 
 		 688 aa  702    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  55.28 
 
 		 692 aa  746    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  55.29 
 
 		 684 aa  748    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  53.54 
 
 		 701 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  53.76 
 
 		 701 aa  708    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  51.91 
 
 		 685 aa  701    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  53.76 
 
 		 701 aa  708    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5666  carbon starvation protein A  55.96 
 
 		 691 aa  690    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.139081  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  55.35 
 
 		 690 aa  709    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  55.87 
 
 		 681 aa  702    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5596  carbon starvation protein A  55.96 
 
 		 691 aa  689    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5540  carbon starvation protein A  56.11 
 
 		 691 aa  692    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.298925  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  56.97 
 
 		 692 aa  735    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2468  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 756 aa  1486    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  53.85 
 
 		 686 aa  726    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  53.54 
 
 		 701 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  57.01 
 
 		 696 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0334  carbon starvation protein CstA  55.8 
 
 		 689 aa  731    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  53.76 
 
 		 701 aa  707    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  57.44 
 
 		 696 aa  751    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02026  carbon starvation protein A  52.27 
 
 		 690 aa  657    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5511  carbon starvation protein A  55.82 
 
 		 691 aa  688    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  55.06 
 
 		 691 aa  736    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  56.49 
 
 		 681 aa  746    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  55.57 
 
 		 692 aa  748    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1798  carbon starvation protein CstA  59.8 
 
 		 764 aa  786    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0422  carbon starvation protein CstA  64.79 
 
 		 707 aa  887    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  53.9 
 
 		 688 aa  701    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  55.43 
 
 		 692 aa  747    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3929  carbon starvation protein CstA  55.82 
 
 		 691 aa  709    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  55.72 
 
 		 692 aa  748    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  53.76 
 
 		 701 aa  708    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  53.54 
 
 		 701 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  53.76 
 
 		 701 aa  708    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  55.52 
 
 		 691 aa  742    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  56.4 
 
 		 692 aa  736    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  53.75 
 
 		 688 aa  702    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  53.17 
 
 		 701 aa  694    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  55.57 
 
 		 692 aa  750    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60950  hypothetical protein  53.43 
 
 		 688 aa  687    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D14  carbon starvation protein, membrane protein  46.46 
 
 		 784 aa  669    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0459  carbon starvation protein, membrane protein  46.73 
 
 		 784 aa  674    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  54.31 
 
 		 766 aa  723    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  55.57 
 
 		 692 aa  748    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  55.54 
 
 		 692 aa  731    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  51.52 
 
 		 688 aa  722    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  53.54 
 
 		 701 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  51.19 
 
 		 692 aa  680    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5411  carbon starvation protein A  55.74 
 
 		 692 aa  691    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  51.38 
 
 		 688 aa  720    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1845  carbon starvation protein CstA  59.8 
 
 		 764 aa  786    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2024  carbon starvation protein CstA  58.35 
 
 		 767 aa  767    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  55.44 
 
 		 684 aa  735    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  55.67 
 
 		 691 aa  733    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  54.56 
 
 		 687 aa  726    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0831  carbon starvation protein CstA  54.18 
 
 		 765 aa  757    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.464079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  55.88 
 
 		 692 aa  752    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  55.74 
 
 		 688 aa  739    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  55.23 
 
 		 685 aa  742    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  54.85 
 
 		 686 aa  702    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  56.82 
 
 		 692 aa  735    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1779  carbon starvation protein CstA  59.8 
 
 		 764 aa  786    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0424858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  56.82 
 
 		 692 aa  735    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  52.43 
 
 		 690 aa  720    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13080  carbon starvation protein A cstA  56.82 
 
 		 758 aa  728    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.585892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4322  carbon starvation protein CstA  59.2 
 
 		 768 aa  767    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  57.36 
 
 		 687 aa  724    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16560  carbon starvation protein, predicted membrane protein  63.36 
 
 		 739 aa  852    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  53.31 
 
 		 701 aa  701    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  55.23 
 
 		 685 aa  742    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  56.11 
 
 		 692 aa  756    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5246  hypothetical protein  53.73 
 
 		 688 aa  691    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526555  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  53.54 
 
 		 701 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2627  carbon starvation protein CstA  55.11 
 
 		 682 aa  697    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.61212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4341  carbon starvation protein CstA  54.94 
 
 		 684 aa  673    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278499  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  53.9 
 
 		 688 aa  702    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>