232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4322 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  52.33 
 
 
691 aa  685    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  51.88 
 
 
701 aa  683    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  51.3 
 
 
690 aa  686    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  52.12 
 
 
701 aa  681    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  52.28 
 
 
688 aa  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13080  carbon starvation protein A cstA  74.43 
 
 
758 aa  1080    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.585892  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  53.35 
 
 
691 aa  685    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  53.51 
 
 
686 aa  700    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1186  carbon starvation protein CstA  50.07 
 
 
707 aa  660    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0310498  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3378  carbon starvation protein CstA  60.16 
 
 
745 aa  818    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360785  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0831  carbon starvation protein CstA  59.13 
 
 
765 aa  900    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.464079 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  53.7 
 
 
692 aa  695    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  51.74 
 
 
691 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1572  carbon starvation protein CstA  58.65 
 
 
723 aa  823    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487074  normal  0.864906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  52.22 
 
 
688 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3361  carbon starvation protein CstA  75.72 
 
 
765 aa  1147    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15010  carbon starvation protein, predicted membrane protein  59.41 
 
 
762 aa  862    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.273232  normal  0.768421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  53.27 
 
 
691 aa  671    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  51.38 
 
 
701 aa  668    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  52.02 
 
 
701 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  53.7 
 
 
692 aa  695    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  52.63 
 
 
690 aa  683    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  54.31 
 
 
692 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  51.04 
 
 
688 aa  658    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  53.55 
 
 
692 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  52.92 
 
 
684 aa  693    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  52.96 
 
 
688 aa  665    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  52.1 
 
 
687 aa  688    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  52.47 
 
 
691 aa  674    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  50.51 
 
 
688 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0334  carbon starvation protein CstA  60.45 
 
 
740 aa  787    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  52.78 
 
 
690 aa  669    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  53.39 
 
 
681 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  53.61 
 
 
685 aa  695    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  52.02 
 
 
701 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  53.01 
 
 
692 aa  683    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2468  carbon starvation protein CstA  59.2 
 
 
756 aa  761    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  51.71 
 
 
686 aa  674    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2987  carbon starvation protein CstA  50.28 
 
 
693 aa  645    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0436073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  55.16 
 
 
696 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0334  carbon starvation protein CstA  51.8 
 
 
689 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4167  carbon starvation protein CstA  59.64 
 
 
742 aa  833    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  54.83 
 
 
696 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0646  carbon starvation protein  47 
 
 
799 aa  659    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.241278  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  52.63 
 
 
684 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  52.52 
 
 
691 aa  686    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  49.06 
 
 
681 aa  654    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  53.7 
 
 
692 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1798  carbon starvation protein CstA  83.36 
 
 
764 aa  1252    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0422  carbon starvation protein CstA  58.23 
 
 
707 aa  759    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  53.21 
 
 
692 aa  696    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5246  hypothetical protein  52.65 
 
 
688 aa  671    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3929  carbon starvation protein CstA  52.26 
 
 
691 aa  643    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  50.36 
 
 
688 aa  679    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  50.51 
 
 
688 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  51.81 
 
 
685 aa  673    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16560  carbon starvation protein, predicted membrane protein  64.58 
 
 
739 aa  922    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  51.88 
 
 
701 aa  683    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  54.61 
 
 
685 aa  695    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  52.37 
 
 
688 aa  672    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  52.02 
 
 
701 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  53.55 
 
 
692 aa  695    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60950  hypothetical protein  52.26 
 
 
688 aa  671    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D14  carbon starvation protein, membrane protein  49.8 
 
 
784 aa  690    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0459  carbon starvation protein, membrane protein  49.18 
 
 
784 aa  693    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  59.81 
 
 
766 aa  874    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  53.7 
 
 
692 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3577  carbon starvation protein CstA  58.13 
 
 
712 aa  770    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0736186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  50.95 
 
 
688 aa  669    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  53.61 
 
 
685 aa  695    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  51.16 
 
 
692 aa  666    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1938  carbon starvation protein CstA  61.27 
 
 
738 aa  847    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.121526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  54.5 
 
 
686 aa  681    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1845  carbon starvation protein CstA  83.36 
 
 
764 aa  1252    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2024  carbon starvation protein CstA  90.89 
 
 
767 aa  1358    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  51.67 
 
 
687 aa  688    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  53.45 
 
 
692 aa  699    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  52.41 
 
 
687 aa  677    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  63.02 
 
 
753 aa  900    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  53.43 
 
 
692 aa  672    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  52.41 
 
 
688 aa  676    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  51.88 
 
 
701 aa  683    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  52.02 
 
 
701 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  54.31 
 
 
692 aa  681    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1779  carbon starvation protein CstA  83.36 
 
 
764 aa  1252    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0424858  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  54.31 
 
 
692 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3105  carbon starvation protein CstA  76.13 
 
 
756 aa  1149    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  51.88 
 
 
701 aa  683    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4322  carbon starvation protein CstA  100 
 
 
768 aa  1527    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269882  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  53.18 
 
 
687 aa  669    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  50.96 
 
 
688 aa  670    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  52.19 
 
 
701 aa  682    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  52.04 
 
 
701 aa  681    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2310  carbon starvation protein CstA  69.68 
 
 
753 aa  1059    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265591  hitchhiker  0.00199124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  52.02 
 
 
701 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2627  carbon starvation protein CstA  51.75 
 
 
682 aa  657    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.61212  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4341  carbon starvation protein CstA  54.5 
 
 
684 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278499  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  52.28 
 
 
688 aa  670    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  54.14 
 
 
692 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5511  carbon starvation protein A  53.13 
 
 
691 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>