232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_D14 on replicon NC_008506
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13080  carbon starvation protein A cstA  47.89 
 
 		 758 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.585892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  50.69 
 
 		 753 aa  715    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1938  carbon starvation protein CstA  48.5 
 
 		 738 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.121526 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0831  carbon starvation protein CstA  50.69 
 
 		 765 aa  728    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.464079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2468  carbon starvation protein CstA  49.11 
 
 		 756 aa  636    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16560  carbon starvation protein, predicted membrane protein  50.88 
 
 		 739 aa  718    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3577  carbon starvation protein CstA  49.32 
 
 		 712 aa  679    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0736186 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0646  carbon starvation protein  47.48 
 
 		 799 aa  710    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.241278  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1798  carbon starvation protein CstA  48.36 
 
 		 764 aa  660    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0422  carbon starvation protein CstA  48.38 
 
 		 707 aa  648    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4167  carbon starvation protein CstA  49.71 
 
 		 742 aa  675    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1572  carbon starvation protein CstA  49.79 
 
 		 723 aa  675    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487074  normal  0.864906 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D14  carbon starvation protein, membrane protein  100 
 
 		 784 aa  1593    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0459  carbon starvation protein, membrane protein  95.79 
 
 		 784 aa  1538    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  51.53 
 
 		 766 aa  703    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15010  carbon starvation protein, predicted membrane protein  55.65 
 
 		 762 aa  818    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.273232  normal  0.768421 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1845  carbon starvation protein CstA  48.36 
 
 		 764 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2024  carbon starvation protein CstA  49.93 
 
 		 767 aa  658    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1779  carbon starvation protein CstA  48.36 
 
 		 764 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0424858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0334  carbon starvation protein CstA  48.31 
 
 		 740 aa  653    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4322  carbon starvation protein CstA  49.73 
 
 		 768 aa  653    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3378  carbon starvation protein CstA  47.75 
 
 		 745 aa  657    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360785  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2310  carbon starvation protein CstA  51.08 
 
 		 753 aa  720    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265591  hitchhiker  0.00199124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3361  carbon starvation protein CstA  51.31 
 
 		 765 aa  719    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3105  carbon starvation protein CstA  51.93 
 
 		 756 aa  717    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  47.81 
 
 		 690 aa  635  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  47.39 
 
 		 692 aa  632  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  47.38 
 
 		 692 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  46.6 
 
 		 686 aa  631  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  47.81 
 
 		 691 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  47.11 
 
 		 692 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  47.1 
 
 		 692 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  48.01 
 
 		 687 aa  629  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  46.39 
 
 		 684 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2294  carbon starvation protein CstA  47.41 
 
 		 685 aa  627  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011541 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  47.25 
 
 		 692 aa  628  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2017  carbon starvation protein CstA  47.41 
 
 		 685 aa  627  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  47.25 
 
 		 692 aa  628  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  47.25 
 
 		 692 aa  628  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  47.03 
 
 		 692 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  47.83 
 
 		 688 aa  624  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  48.3 
 
 		 692 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  46.4 
 
 		 688 aa  621  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  48.52 
 
 		 685 aa  621  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  48.3 
 
 		 692 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  48.3 
 
 		 692 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  47.04 
 
 		 701 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  44.84 
 
 		 701 aa  618  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  46.16 
 
 		 701 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  47.04 
 
 		 701 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  47.04 
 
 		 701 aa  617  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  47.18 
 
 		 692 aa  618  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  46.16 
 
 		 701 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  47.04 
 
 		 701 aa  617  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  46.16 
 
 		 701 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  46.16 
 
 		 701 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  48.15 
 
 		 692 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1186  carbon starvation protein CstA  46.05 
 
 		 707 aa  617  1e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0310498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  47.04 
 
 		 701 aa  617  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  46.16 
 
 		 701 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  46.11 
 
 		 684 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  45.69 
 
 		 701 aa  610  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  45.66 
 
 		 688 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  45.66 
 
 		 688 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0598  carbon starvation protein CstA  47.43 
 
 		 692 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  45.66 
 
 		 688 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  46.16 
 
 		 691 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  46.23 
 
 		 686 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  46.47 
 
 		 688 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  46.15 
 
 		 701 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  47.96 
 
 		 686 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1403  carbon starvation protein CstA  46.5 
 
 		 691 aa  598  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  45.65 
 
 		 690 aa  598  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3619  carbon starvation protein CstA  47.88 
 
 		 681 aa  596  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186111  normal  0.595383 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  44.01 
 
 		 688 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5246  hypothetical protein  47.13 
 
 		 688 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60950  hypothetical protein  47.28 
 
 		 688 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  43.86 
 
 		 688 aa  592  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  47.26 
 
 		 687 aa  594  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  44.01 
 
 		 688 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04220  predicted inner membrane protein  44.15 
 
 		 716 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3643  carbon starvation protein CstA  44.4 
 
 		 716 aa  590  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  46.07 
 
 		 691 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4574  carbon starvation family protein  43.92 
 
 		 721 aa  590  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  48.17 
 
 		 688 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1089  carbon starvation protein CstA  43.8 
 
 		 717 aa  589  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4886  carbon starvation family protein  44.23 
 
 		 716 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  46.49 
 
 		 688 aa  590  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5866  carbon starvation family protein  43.92 
 
 		 721 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  47.19 
 
 		 681 aa  591  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2987  carbon starvation protein CstA  46.43 
 
 		 693 aa  589  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0436073 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  44.96 
 
 		 687 aa  592  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3712  carbon starvation protein CstA  44.26 
 
 		 716 aa  590  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.356115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  44.81 
 
 		 687 aa  590  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4946  carbon starvation family protein  44 
 
 		 721 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4785  carbon starvation family protein  44.23 
 
 		 716 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.741257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4938  carbon starvation family protein  44.23 
 
 		 716 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.457223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4945  carbon starvation family protein  44.23 
 
 		 716 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4859  carbon starvation family protein  44.23 
 
 		 716 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04186  hypothetical protein  44.15 
 
 		 716 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>