176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2150 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2150  IS630 family transposase  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.263283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  81.4 
 
 		 387 aa  279  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  81.4 
 
 		 387 aa  279  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  81.4 
 
 		 387 aa  279  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  57.41 
 
 		 391 aa  193  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  54.37 
 
 		 376 aa  170  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  54.37 
 
 		 365 aa  170  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  39.61 
 
 		 356 aa  95.9  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  39.61 
 
 		 356 aa  95.9  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  39.61 
 
 		 356 aa  95.9  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  33.33 
 
 		 356 aa  88.2  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  30.67 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  30 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  28.48 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  33.55 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  29.33 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  33.11 
 
 		 376 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  27.33 
 
 		 351 aa  72.4  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  31.47 
 
 		 353 aa  72.4  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  31.47 
 
 		 353 aa  72.4  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0450  remnant of ISRSO5-transposase protein  32.48 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.681921  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  31.47 
 
 		 353 aa  72  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  31.47 
 
 		 353 aa  72  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  31.47 
 
 		 353 aa  72  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0103  ISRSO5-transposase protein  32.48 
 
 		 363 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  32.48 
 
 		 363 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  32.48 
 
 		 363 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2176  ISRSO5-transposase protein  32.48 
 
 		 363 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  32.48 
 
 		 363 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  32.48 
 
 		 363 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1152  ISRSO5-transposase protein  32.48 
 
 		 363 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1675  ISRSO5-transposase protein  32.48 
 
 		 363 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 343 aa  71.6  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 353 aa  71.2  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  31.21 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  30.06 
 
 		 366 aa  68.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3194  ISRSO5-transposase protein  30.57 
 
 		 363 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4630  ISRSO5-transposase protein  30.57 
 
 		 363 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00237551  normal  0.103476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5531  ISRSO5-transposase protein  30.57 
 
 		 363 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  32.7 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  29.45 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3844  putative transposase  30.07 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.585584  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  32.14 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  28.66 
 
 		 375 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  29.94 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  32.14 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  30.82 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  29.01 
 
 		 364 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  26.99 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  32.14 
 
 		 356 aa  65.1  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  30.32 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  30.32 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  31.08 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  26.06 
 
 		 357 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  26.06 
 
 		 357 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  26.06 
 
 		 357 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  26.06 
 
 		 357 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  26.06 
 
 		 357 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  28.66 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  29.68 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  27.45 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  27.45 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  29.68 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  29.68 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  29.88 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  29.88 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  27.71 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  29.68 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  27.45 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  31.21 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  26.99 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  28.76 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  28.76 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  28.76 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  28.76 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  28.76 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  28.76 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  28.76 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  28.76 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  28.76 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  28.76 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  28.76 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  28.76 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  28.76 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  28.76 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  28.76 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  30.72 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  30.72 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  30.72 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  30.72 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  28.05 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  29.75 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  27.78 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  29.41 
 
 		 364 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  29.68 
 
 		 583 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  29.41 
 
 		 364 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  29.41 
 
 		 364 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  29.41 
 
 		 364 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  28.9 
 
 		 366 aa  58.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>