25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2029 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2029  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  303  7e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.775035  normal  0.520928 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  78.57 
 
 		 535 aa  141  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  85.14 
 
 		 527 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  76.54 
 
 		 346 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  87.65 
 
 		 503 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  70.73 
 
 		 484 aa  124  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  75.31 
 
 		 537 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  70.73 
 
 		 519 aa  124  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2732  recombinase  73.49 
 
 		 583 aa  117  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1837  hypothetical protein  66.67 
 
 		 509 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  79.27 
 
 		 526 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  78.05 
 
 		 519 aa  110  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  61.45 
 
 		 514 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  62.86 
 
 		 181 aa  86.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2699  hypothetical protein  54.43 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.979675  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  56.72 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  59.76 
 
 		 565 aa  57.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  37.8 
 
 		 575 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2537  recombinase  41.51 
 
 		 556 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  44.26 
 
 		 554 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2909  recombinase  37.04 
 
 		 465 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  40.38 
 
 		 548 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  40.38 
 
 		 548 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  40.38 
 
 		 548 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  40.38 
 
 		 548 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>