224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1254 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  666    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  66.42 
 
 		 337 aa  317  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  44.49 
 
 		 253 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  41.83 
 
 		 261 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  42.91 
 
 		 250 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  39.05 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  41.67 
 
 		 253 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  39.78 
 
 		 253 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  42.39 
 
 		 261 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  38.76 
 
 		 224 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  36.78 
 
 		 233 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  39.69 
 
 		 239 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  42.21 
 
 		 226 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  39.34 
 
 		 253 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  43.28 
 
 		 253 aa  162  8.000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  38.26 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  40.23 
 
 		 247 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  39.85 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  36.54 
 
 		 233 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  37.69 
 
 		 268 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  38.64 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  37.59 
 
 		 252 aa  155  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  38.85 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  37.72 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  37.18 
 
 		 248 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  39.07 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  37.26 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  41.79 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  37.84 
 
 		 221 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  34.87 
 
 		 238 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  32.18 
 
 		 234 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  44.75 
 
 		 232 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  35.23 
 
 		 227 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  35.77 
 
 		 226 aa  149  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  38.46 
 
 		 248 aa  149  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  36.29 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  41 
 
 		 222 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  36.03 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  35.38 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  34.95 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  37.31 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  36.7 
 
 		 236 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  36.61 
 
 		 231 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  38.7 
 
 		 222 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  37.02 
 
 		 242 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  35.29 
 
 		 281 aa  143  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  37.98 
 
 		 221 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  36.54 
 
 		 256 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  33.81 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  35.02 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  36.26 
 
 		 257 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  35.74 
 
 		 224 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  35.53 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  33.46 
 
 		 235 aa  135  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  35.16 
 
 		 255 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  34.94 
 
 		 254 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  36.5 
 
 		 244 aa  133  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  35.36 
 
 		 262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  38.62 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  39.11 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  36.43 
 
 		 254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  34.63 
 
 		 219 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  34.59 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  37.17 
 
 		 248 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  35.84 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  38.08 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  33.84 
 
 		 224 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  34.39 
 
 		 251 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  34.6 
 
 		 268 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  33.67 
 
 		 266 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  33.67 
 
 		 266 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  35.27 
 
 		 255 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  32.79 
 
 		 222 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  34.05 
 
 		 290 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10600  hypothetical protein  37.37 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546903  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  47.13 
 
 		 224 aa  125  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  38.02 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  30.52 
 
 		 222 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  35.66 
 
 		 236 aa  123  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0546  hypothetical protein  33.44 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  36.43 
 
 		 221 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  33.74 
 
 		 222 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  34.97 
 
 		 222 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  34.97 
 
 		 222 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  30.98 
 
 		 217 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1085  hypothetical protein  33.58 
 
 		 217 aa  116  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0480767  normal  0.170252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  31.97 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  36.52 
 
 		 231 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  30.22 
 
 		 234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  31.56 
 
 		 237 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  36.68 
 
 		 243 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  34.23 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  29.23 
 
 		 232 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  38.18 
 
 		 254 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1782  protein of unknown function DUF159  34.13 
 
 		 247 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.178705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  34.87 
 
 		 243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3704  protein of unknown function DUF159  32.32 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 238 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  38.2 
 
 		 226 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>