More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1109 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1109  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 127 aa  253  6e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000625282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1365  50S ribosomal protein L17  59.84 
 
 		 131 aa  157  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1321  50S ribosomal protein L17  59.84 
 
 		 131 aa  157  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000123779  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0982  50S ribosomal protein L17  62.7 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0761  ribosomal protein L17  50 
 
 		 128 aa  130  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0290  ribosomal protein L17  42.86 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  46.88 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  43.31 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  42.52 
 
 		 133 aa  104  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  46.46 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  41.73 
 
 		 131 aa  103  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  47.62 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  41.73 
 
 		 131 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  41.73 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  40.94 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  41.73 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  43.65 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  45.24 
 
 		 117 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  45.24 
 
 		 117 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  40.94 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  44.88 
 
 		 226 aa  100  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  43.65 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  39.68 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  41.73 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  40.94 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  46.03 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  42.06 
 
 		 131 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  43.65 
 
 		 162 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  43.65 
 
 		 116 aa  98.6  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  43.65 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  41.73 
 
 		 176 aa  98.2  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  42.52 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1643  ribosomal protein L17  40.94 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1941  ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 116 aa  98.2  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2590  50S ribosomal protein L17  42.24 
 
 		 161 aa  98.2  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000445959  normal  0.680222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 		 130 aa  97.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 130 aa  97.8  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 129 aa  97.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  40.16 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 128 aa  97.4  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  40.94 
 
 		 133 aa  97.4  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  39.37 
 
 		 129 aa  97.1  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  40.94 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  39.84 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  39.37 
 
 		 129 aa  95.9  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  39.37 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  39.37 
 
 		 129 aa  95.9  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  39.37 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  39.37 
 
 		 129 aa  95.9  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  43.31 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  43.31 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2038  ribosomal protein L17  41.41 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0128526  hitchhiker  0.000448232 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  40.94 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  41.73 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0200  ribosomal protein L17  42.19 
 
 		 171 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  40.16 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  38.58 
 
 		 190 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  38.58 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  39.37 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  40.94 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  41.27 
 
 		 131 aa  94.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  40.94 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  40.94 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  40.94 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>