226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0880 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0880  aspartate alpha-decarboxylase  100 
 
 		 116 aa  229  9e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.399475  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0284  aspartate alpha-decarboxylase  69.83 
 
 		 119 aa  167  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000351643  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1841  aspartate alpha-decarboxylase  58.77 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  47.46 
 
 		 131 aa  116  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  51.33 
 
 		 133 aa  114  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  50.44 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3067  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.439202  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  53.64 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  51.33 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  49.15 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0652  aspartate alpha-decarboxylase  49.15 
 
 		 120 aa  110  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.573242  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  49.58 
 
 		 128 aa  110  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2075  aspartate alpha-decarboxylase  48.74 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1263  aspartate 1-decarboxylase  48.28 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.833661 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6002  aspartate alpha-decarboxylase  47.9 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  47.9 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  48.74 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  51.28 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  51.28 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  43.1 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  42.98 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0465  aspartate 1-decarboxylase  50.44 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  48.74 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  47.32 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  48.74 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1062  aspartate 1-decarboxylase  46.96 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  47.86 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  48.74 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  48.74 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  48.74 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  48.74 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  42.74 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  50.44 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  47.9 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  47.01 
 
 		 126 aa  107  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3569  aspartate alpha-decarboxylase  45.76 
 
 		 120 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0169  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266138 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0182  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00439449  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  47.06 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  47.06 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  47.06 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  44.44 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  50.43 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00688  aspartate alpha-decarboxylase  51.79 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42730  aspartate alpha-decarboxylase  46.55 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  47.86 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1450  aspartate alpha-decarboxylase  51.35 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  46.15 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  46.15 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2108  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0321908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  47.06 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  47.06 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  43.59 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  44.92 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  44.92 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  47.01 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  46.22 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62600  aspartate alpha-decarboxylase  46.55 
 
 		 126 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  46.22 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  47.01 
 
 		 127 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1803  aspartate alpha-decarboxylase  53.57 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  46.09 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1875  aspartate 1-decarboxylase  44.74 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  47.86 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0408  aspartate alpha-decarboxylase  51.35 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.293009  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  45.22 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  45.22 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  46.22 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  47.06 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  44.54 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  45.22 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  46.22 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  42.86 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  43.86 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  45.22 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  42.86 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  43.86 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  42.86 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5448  aspartate alpha-decarboxylase  45.69 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1520  aspartate alpha-decarboxylase  49.11 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  42.98 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0310  aspartate alpha-decarboxylase  51.35 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0412  aspartate alpha-decarboxylase  52.25 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2220  aspartate 1-decarboxylase  47.75 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  45.3 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  42.74 
 
 		 145 aa  100  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  44.74 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_706  aspartate 1-decarboxylase  43.59 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  40.17 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>