More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2909 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 		 399 aa  819    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499459  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10273  alanine dehydrogenase  66.42 
 
 		 399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1939  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  53.35 
 
 		 390 aa  433  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1259  Alanine dehydrogenase  52.47 
 
 		 405 aa  418  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4284  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  51.43 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2994  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  45.99 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0579773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2439  pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit  48.41 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4962  Alanine dehydrogenase  46.77 
 
 		 408 aa  364  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0465  alanine dehydrogenase  42.82 
 
 		 406 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  41.82 
 
 		 406 aa  290  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1878  alanine dehydrogenase  41.29 
 
 		 377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  40.91 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0767  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  40.7 
 
 		 403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0761  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  40.54 
 
 		 406 aa  282  8.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  39.13 
 
 		 406 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2150  Alanine dehydrogenase  39.3 
 
 		 406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  37.02 
 
 		 371 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  37.71 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  35.71 
 
 		 371 aa  243  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  36.39 
 
 		 367 aa  243  6e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  37.02 
 
 		 373 aa  243  6e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  35.26 
 
 		 370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  34.71 
 
 		 371 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  34.33 
 
 		 371 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  35.71 
 
 		 369 aa  236  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  35.29 
 
 		 372 aa  235  9e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  34.42 
 
 		 376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  34.44 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  34.44 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  34.07 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  34.07 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  33.51 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  36.54 
 
 		 371 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0906  L-alanine dehydrogenase  36.29 
 
 		 367 aa  233  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  33.68 
 
 		 390 aa  232  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  37.64 
 
 		 363 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  34.14 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  34.16 
 
 		 371 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  34.05 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  34.16 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  34.06 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  34.06 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  34.06 
 
 		 371 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  34.16 
 
 		 371 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  33.6 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  36.64 
 
 		 374 aa  230  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  33.78 
 
 		 373 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  33.24 
 
 		 366 aa  229  7e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3772  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  37.64 
 
 		 363 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  0.386692 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  34.07 
 
 		 374 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  33.42 
 
 		 370 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0055  L-alanine dehydrogenase  35.16 
 
 		 373 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.161285  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  33.61 
 
 		 371 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2630  alanine dehydrogenase  38.8 
 
 		 370 aa  227  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0012805  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  35.13 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  33.87 
 
 		 371 aa  225  9e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  33.52 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1445  L-alanine dehydrogenase  36.57 
 
 		 377 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  34.33 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0984  alanine dehydrogenase  37 
 
 		 370 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0509355  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  34.25 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  32.51 
 
 		 365 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  34.54 
 
 		 371 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  33.52 
 
 		 371 aa  224  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  35.95 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  35.57 
 
 		 371 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  33.8 
 
 		 376 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  35.95 
 
 		 370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  32.26 
 
 		 371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  33.7 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  33.7 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  33.24 
 
 		 377 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  33.33 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  33.7 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  33.33 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  33.33 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  33.7 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  33.33 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  33.7 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  33.33 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  33.33 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  33.7 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  33.7 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  33.33 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  33.7 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  33.7 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  33.24 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2026  alanine dehydrogenase  34.41 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  unclonable  0.00000166199 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  33.7 
 
 		 377 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  33.24 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  32.97 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  35.75 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  35.71 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  34.07 
 
 		 371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1608  alanine dehydrogenase  34.9 
 
 		 370 aa  220  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0320877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  35.18 
 
 		 372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  33.71 
 
 		 360 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  35.41 
 
 		 371 aa  219  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1760  L-alanine dehydrogenase  35.34 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  31.02 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>