24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2821 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2821  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  352  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0738374  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1368  transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000513137  normal  0.127219 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  35.03 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1588  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  55.1 
 
 		 103 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1641  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0781  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0290139  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1186  transciptional regulator  44.64 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000178331  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1386  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2138  XRE family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 268 aa  45.1  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 139 aa  44.7  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3743  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0174083  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 71 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4993  hypothetical protein  43.14 
 
 		 226 aa  42.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3341  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 68 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5034  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 231 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2103  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3919  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 104 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2845  hypothetical protein  37.93 
 
 		 142 aa  41.6  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1289  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 136 aa  41.2  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.279078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2738  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 142 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>