More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1523 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1523  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
128 aa  263  7e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.383106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01013  hypothetical protein  89.06 
 
 
128 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2632  Endoribonuclease L-PSP  89.06 
 
 
128 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.763803  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1128  rutC protein  89.06 
 
 
128 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2115  rutC protein  89.06 
 
 
128 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2585  endoribonuclease L-PSP  89.06 
 
 
128 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0607666 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1125  rutC protein  89.06 
 
 
128 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01020  hypothetical protein  89.06 
 
 
128 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1821  endoribonuclease L-PSP  76.56 
 
 
128 aa  214  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.012204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  75.59 
 
 
127 aa  209  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  76.56 
 
 
129 aa  208  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4840  Endoribonuclease L-PSP  75 
 
 
130 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1155  endoribonuclease L-PSP family protein  73.23 
 
 
127 aa  205  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0997  endoribonuclease L-PSP  72.44 
 
 
127 aa  203  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1077  Endoribonuclease L-PSP  71.09 
 
 
130 aa  201  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0180844  normal  0.0247338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1582  endoribonuclease L-PSP  70.31 
 
 
128 aa  199  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2055  Endoribonuclease L-PSP  71.09 
 
 
130 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1736  endoribonuclease L-PSP  71.09 
 
 
130 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3937  pyrimidine utilization protein C  62.2 
 
 
130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166806  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 
127 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 
126 aa  90.1  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  34.96 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
126 aa  84.3  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 
124 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  35.16 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 
125 aa  82  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 
227 aa  80.5  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  35.09 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6185  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89906  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  32 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
126 aa  77  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 
126 aa  77  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  32.26 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  30.97 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  34.35 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  28.95 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  30.36 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  30.36 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  30.36 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  30.33 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  30.16 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  28.23 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  28.8 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  31.45 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>