More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1314 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_1314  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 357 aa  734    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499254  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03519  putative transcriptional regulator  72.47 
 
 		 364 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03470  hypothetical protein  72.47 
 
 		 356 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2354  transcriptional regulator, LacI family  61.24 
 
 		 356 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2628  transcriptional regulator, LacI family  60.39 
 
 		 356 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1641  transcriptional regulator, LacI family  59.83 
 
 		 357 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.236948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1610  transcriptional regulator, LacI family  58.99 
 
 		 356 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.42043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3600  LacI family transcription regulator  57.1 
 
 		 360 aa  428  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0280148  normal  0.188315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0979  LacI family transcription regulator  53.2 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0927  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  53.2 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3362  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  53.2 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1883  transcriptional regulator, LacI family  31.1 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1697  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 351 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3669  transcriptional regulator, LacI family  29.45 
 
 		 349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0717  transcriptional regulator, LacI family  28.24 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0665  transcriptional regulator, LacI family  29.41 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0509948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3520  transcriptional regulator, LacI family  28.48 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  27.09 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3579  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.64 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5764  transcriptional regulator LacI family  27.88 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.73775  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5365  transcriptional regulator, LacI family  24.78 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000864241  normal  0.850622 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  25.73 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  26.96 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  27.95 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  27.44 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5085  transcriptional regulator, LacI family  24.42 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  26.04 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  27.64 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  28 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  27.51 
 
 		 332 aa  97.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  28.7 
 
 		 347 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  25.44 
 
 		 368 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  25.21 
 
 		 341 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  25.21 
 
 		 341 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  25.21 
 
 		 341 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.21 
 
 		 341 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.21 
 
 		 341 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.21 
 
 		 341 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.21 
 
 		 343 aa  96.3  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  25.53 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.21 
 
 		 330 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.21 
 
 		 343 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  27.14 
 
 		 335 aa  95.9  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.01 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.43 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.86 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13210  transcriptional regulator, LacI family  25.59 
 
 		 345 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2353  LacI family transcription regulator  24.78 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000399478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.38 
 
 		 342 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.38 
 
 		 342 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0382  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 360 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  27.43 
 
 		 333 aa  93.2  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.6 
 
 		 330 aa  92.8  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4339  LacI family transcription regulator  30.21 
 
 		 373 aa  92.8  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  27.36 
 
 		 335 aa  92.8  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4007  transcriptional regulator, LacI family  26.3 
 
 		 343 aa  92.8  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3312  LacI family transcription regulator  26.79 
 
 		 336 aa  92.4  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.09 
 
 		 342 aa  92.8  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  27.32 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  26.39 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  26.82 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  26.74 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2210  transcriptional regulator, LacI family  28.77 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  27.14 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3367  transcriptional regulator, LacI family  24.93 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.5 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2999  transcriptional regulator, LacI family  23.3 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  26.42 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  27.62 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  25.29 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  26.2 
 
 		 333 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.39 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  24.57 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  26.72 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4438  transcriptional regulator, LacI family  29 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  26.16 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.07 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4336  transcriptional regulator, LacI family  26.02 
 
 		 339 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563264  hitchhiker  0.000141472 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  26.16 
 
 		 343 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  26.72 
 
 		 343 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  26.16 
 
 		 343 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  26.16 
 
 		 343 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  25.86 
 
 		 343 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  24.76 
 
 		 344 aa  89.7  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  28.07 
 
 		 353 aa  89.4  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  29.34 
 
 		 339 aa  89.4  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  25.07 
 
 		 328 aa  89.4  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1003  LacI family transcription regulator  24.76 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  26.16 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  23.46 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  25.29 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  25.37 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  27.95 
 
 		 338 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  25.07 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  25.44 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  26.16 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  24.2 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.35 
 
 		 338 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2742  LacI family transcription regulator  24.2 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>