23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0410 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0410  O-antigen polymerase  100 
 
 		 552 aa  1104    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  26.99 
 
 		 561 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  26.84 
 
 		 594 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4715  O-antigen polymerase  32.09 
 
 		 545 aa  156  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  27.82 
 
 		 597 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0446  O-antigen polymerase  26.33 
 
 		 585 aa  125  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  28.28 
 
 		 544 aa  124  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  26.5 
 
 		 579 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  29.1 
 
 		 607 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2461  O-antigen polymerase  25.34 
 
 		 580 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  30 
 
 		 459 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 594 aa  51.6  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0423  O-antigen polymerase  20.14 
 
 		 557 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  28.3 
 
 		 686 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  28.3 
 
 		 686 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  27.74 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  27.97 
 
 		 560 aa  48.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  30.91 
 
 		 894 aa  47.4  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1503  binding-protein-dependent transport system protein  34.15 
 
 		 501 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.200132  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  25.47 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 512 aa  44.3  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  29.11 
 
 		 595 aa  44.3  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1664  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 806 aa  43.9  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>