194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0564 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0564  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
93 aa  179  8.000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  35.37 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  32.56 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  30.85 
 
 
94 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  31.4 
 
 
110 aa  52  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  38.54 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  31.4 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  35.11 
 
 
114 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  35.53 
 
 
90 aa  51.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  38.37 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  30 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  38.37 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  30.77 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  30 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  30.34 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  31.76 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  34.02 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  33.75 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  34.02 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  34.02 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  34.02 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  32.5 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  34.02 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  34.02 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  34.02 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  35.37 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  30.34 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  31.76 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  34.88 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  31.25 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  31.25 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  33.75 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  30.99 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  34.88 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  34.88 
 
 
108 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  32.95 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  37.21 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  34.88 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  34.88 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  34.88 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  34.88 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  34.88 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  34.78 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  33.75 
 
 
111 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  33.75 
 
 
111 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  30.99 
 
 
90 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  34.15 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  33.75 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  33.72 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  31.52 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  30.99 
 
 
90 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  33.68 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  34.88 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  28.41 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  33.75 
 
 
111 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  35.9 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  31.4 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  39.13 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  36.17 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  32.98 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  31.4 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  35.11 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  35.11 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  35.11 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  32.61 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  34.04 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  35.11 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  29.89 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1402  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000229037  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  31.25 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0942  preprotein translocase, YajC subunit  29.49 
 
 
110 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.129581  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  30.23 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1790  preprotein translocase, YajC subunit  38.37 
 
 
90 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167941  hitchhiker  0.00454541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  32.5 
 
 
111 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  35.63 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01346  preprotein translocase subunit YajC  33.73 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153767  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  32.5 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  35.63 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  35.11 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  27.78 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  34.41 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  30.95 
 
 
108 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  29.35 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  32.1 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000152664  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  31.52 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  34.78 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  32.56 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  27.78 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  35.48 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  29.07 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  32.22 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  32.43 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  26.97 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>