98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4765 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  714    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  86.63 
 
 		 344 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  82.27 
 
 		 341 aa  590  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  82.85 
 
 		 341 aa  580  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  73.89 
 
 		 345 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  73.89 
 
 		 345 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  65.1 
 
 		 354 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  72.47 
 
 		 256 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  54.46 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  57.37 
 
 		 352 aa  378  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  55.38 
 
 		 342 aa  371  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  55.08 
 
 		 365 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  47.13 
 
 		 333 aa  332  4e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  51.69 
 
 		 350 aa  323  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  50.97 
 
 		 342 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  49.84 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  47.27 
 
 		 343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  49.84 
 
 		 336 aa  309  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  50.65 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  44.58 
 
 		 342 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  45 
 
 		 342 aa  294  2e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  43.31 
 
 		 344 aa  294  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  46.03 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  45.14 
 
 		 358 aa  289  4e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  43.57 
 
 		 333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  44.88 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  46.33 
 
 		 352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  44.38 
 
 		 332 aa  286  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  42.39 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  44.27 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  44.89 
 
 		 369 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  44.86 
 
 		 335 aa  279  5e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  43.35 
 
 		 344 aa  275  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  43.48 
 
 		 334 aa  275  7e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  45.31 
 
 		 350 aa  275  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  43.65 
 
 		 353 aa  275  8e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  42.39 
 
 		 342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  40.83 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  42.32 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  42.15 
 
 		 361 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  41.77 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  42.38 
 
 		 352 aa  270  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  40.98 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  42.86 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  40.67 
 
 		 352 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  41.16 
 
 		 353 aa  266  4e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  44.55 
 
 		 343 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  42.99 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  41.8 
 
 		 355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  41.8 
 
 		 355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  41.1 
 
 		 337 aa  259  6e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  43.69 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  42.6 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  41.09 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  40.32 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  39.68 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  41.11 
 
 		 281 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  47.44 
 
 		 242 aa  215  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  33.13 
 
 		 344 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  47.93 
 
 		 337 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  48.76 
 
 		 141 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  47.93 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  46.55 
 
 		 144 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  39.52 
 
 		 210 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  42.74 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  41.13 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  35.48 
 
 		 197 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  38.58 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  37.88 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  38.17 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  36.08 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  34.96 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  32.56 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  32.56 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  37.19 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  37.7 
 
 		 192 aa  96.3  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  35.54 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  37.07 
 
 		 127 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  36.21 
 
 		 126 aa  94  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  36.29 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  39.13 
 
 		 154 aa  89.7  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  30.23 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  35.65 
 
 		 330 aa  86.7  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  31.93 
 
 		 135 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  34.13 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  42.31 
 
 		 108 aa  73.9  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  39.51 
 
 		 164 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  36 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  31.4 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1274  virulence protein-like protein  37.11 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 90 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  41.54 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4013  hypothetical protein  57.41 
 
 		 48 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 81 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03541  conserved hypothetical protein  54.55 
 
 		 49 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3870  hypothetical protein  54.55 
 
 		 49 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0047  conserved hypothetical protein  55.56 
 
 		 48 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  29.82 
 
 		 88 aa  43.1  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.454055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>