247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1583 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  98.69 
 
 		 457 aa  910    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2026  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  98.47 
 
 		 457 aa  906    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  86.56 
 
 		 457 aa  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  100 
 
 		 457 aa  922    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  98.69 
 
 		 457 aa  911    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  98.69 
 
 		 457 aa  910    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  99.12 
 
 		 457 aa  914    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  98.69 
 
 		 457 aa  910    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0789  glucuronide transporter  44.84 
 
 		 469 aa  327  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  32.7 
 
 		 476 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4405  glucuronide carrier protein  33.19 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4227  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.05 
 
 		 473 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4340  inner membrane symporter YihP  33.77 
 
 		 460 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  32.27 
 
 		 461 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4249  inner membrane symporter YihP  33.55 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4294  inner membrane symporter YihP  33.55 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5323  sugar transporter family protein  33.55 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4293  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.26 
 
 		 472 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4339  putative permease  33.26 
 
 		 474 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4248  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.04 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4262  sugar transporter family protein  33.33 
 
 		 461 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  33.55 
 
 		 468 aa  227  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4406  inner membrane symporter YihP  33.19 
 
 		 460 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0907861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4228  inner membrane symporter YihP  33.19 
 
 		 460 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5322  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter family protein  33.48 
 
 		 467 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.357419 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4109  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.33 
 
 		 461 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03762  predicted transporter  33.11 
 
 		 468 aa  223  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03711  hypothetical protein  33.11 
 
 		 468 aa  223  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4261  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  33.12 
 
 		 467 aa  223  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03761  predicted transporter  33.33 
 
 		 467 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4110  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  32.82 
 
 		 467 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 467 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4399  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  33.04 
 
 		 467 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.44 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31.02 
 
 		 471 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  31.31 
 
 		 443 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  31.75 
 
 		 465 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.11 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  33.33 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  33.11 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.09 
 
 		 463 aa  213  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  33.11 
 
 		 441 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  30.99 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  30.77 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  31.63 
 
 		 442 aa  209  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  31.61 
 
 		 443 aa  208  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  31.39 
 
 		 467 aa  207  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.7 
 
 		 442 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.44 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.73 
 
 		 448 aa  203  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31.75 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.01 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1592  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31.33 
 
 		 464 aa  197  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00442608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.57 
 
 		 466 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1675  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  32.79 
 
 		 462 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2602  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.33 
 
 		 475 aa  194  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.47 
 
 		 472 aa  193  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.58 
 
 		 475 aa  191  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  30.55 
 
 		 468 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  29.96 
 
 		 468 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  30.55 
 
 		 468 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  30.55 
 
 		 468 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31.09 
 
 		 460 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.63 
 
 		 444 aa  189  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  30.18 
 
 		 468 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.38 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1593  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31.15 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.113599  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.91 
 
 		 465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  30.22 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.6 
 
 		 465 aa  180  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2372  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.89 
 
 		 457 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1245  Na+/xyloside symporter related transporter  28.51 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.66 
 
 		 497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  28.98 
 
 		 462 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  28.29 
 
 		 479 aa  170  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  28.48 
 
 		 460 aa  170  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.48 
 
 		 460 aa  169  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  28.48 
 
 		 460 aa  169  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3275  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.4 
 
 		 513 aa  169  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  28.29 
 
 		 479 aa  169  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  28.29 
 
 		 479 aa  169  9e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1997  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.57 
 
 		 477 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  26.65 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1193  Na+/xyloside symporter or related transporter  29.89 
 
 		 437 aa  167  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255847  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  28.35 
 
 		 460 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.8 
 
 		 474 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.49 
 
 		 471 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.8 
 
 		 474 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.8 
 
 		 474 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  28.35 
 
 		 460 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  28.35 
 
 		 460 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  28.35 
 
 		 460 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  28.26 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  28.26 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  28.26 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.12 
 
 		 471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0020  xylose-proton symporter  28.64 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000106497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.69 
 
 		 478 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.23 
 
 		 477 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.77 
 
 		 481 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>