More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1351 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0526  L-aspartate oxidase  77.8 
 
 		 530 aa  862    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.761934 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1829  L-aspartate oxidase  71.35 
 
 		 534 aa  801    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0426262  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0806  L-aspartate oxidase  61.51 
 
 		 541 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1373  L-aspartate oxidase  61.48 
 
 		 527 aa  671    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.588403  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0686  L-aspartate oxidase  60.3 
 
 		 527 aa  663    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.28562  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1351  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 528 aa  1086    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.35363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1003  L-aspartate oxidase  48.5 
 
 		 534 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  46.52 
 
 		 533 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  42.96 
 
 		 533 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  45.96 
 
 		 534 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0437  L-aspartate oxidase  46.49 
 
 		 534 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0330  L-aspartate oxidase  44.82 
 
 		 511 aa  405  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  44.19 
 
 		 541 aa  405  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  44.19 
 
 		 531 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  45.79 
 
 		 532 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  45.11 
 
 		 538 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  45.11 
 
 		 538 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0787  L-aspartate oxidase  45.44 
 
 		 518 aa  399  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.481111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  42.24 
 
 		 579 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  42.91 
 
 		 531 aa  398  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  43.48 
 
 		 531 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  44.44 
 
 		 528 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0041  L-aspartate oxidase  44.76 
 
 		 563 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.852178  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  43.92 
 
 		 535 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  43.21 
 
 		 531 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  42.26 
 
 		 533 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  43.83 
 
 		 535 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  44.83 
 
 		 535 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  43.64 
 
 		 535 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  41.95 
 
 		 538 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  42.62 
 
 		 538 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  43.61 
 
 		 539 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  42.43 
 
 		 538 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  43.02 
 
 		 537 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  42.26 
 
 		 533 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  42.97 
 
 		 531 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  42.13 
 
 		 539 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  42.51 
 
 		 534 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  43.21 
 
 		 537 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  43.98 
 
 		 541 aa  388  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  42.51 
 
 		 535 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  42.64 
 
 		 536 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  42.34 
 
 		 539 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  43.34 
 
 		 534 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0700  L-aspartate oxidase  43.16 
 
 		 560 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.224006  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  42.83 
 
 		 537 aa  388  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  43.18 
 
 		 534 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  42.34 
 
 		 531 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  42.64 
 
 		 536 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  42.64 
 
 		 537 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  43.18 
 
 		 542 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 		 538 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  43.64 
 
 		 542 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  44.44 
 
 		 532 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  43.49 
 
 		 532 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  41.5 
 
 		 532 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  42.43 
 
 		 538 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  42.45 
 
 		 545 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  42.34 
 
 		 525 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  42.51 
 
 		 534 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  42.45 
 
 		 533 aa  385  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  42.15 
 
 		 555 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  43.1 
 
 		 532 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  42.45 
 
 		 533 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  42.32 
 
 		 534 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  42.45 
 
 		 536 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  42.64 
 
 		 537 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  43.18 
 
 		 538 aa  385  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  42.45 
 
 		 537 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  42.94 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  39.74 
 
 		 543 aa  385  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  42.75 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  42.75 
 
 		 540 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  43.87 
 
 		 533 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  41.92 
 
 		 539 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  42.56 
 
 		 530 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  42.75 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  42 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  42 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  42 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  41.81 
 
 		 552 aa  381  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  42.06 
 
 		 543 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  42.26 
 
 		 537 aa  381  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  42.29 
 
 		 552 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  43.87 
 
 		 533 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  42.75 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  43.87 
 
 		 533 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  42.75 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  42 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  41.4 
 
 		 531 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  42.72 
 
 		 535 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  42.45 
 
 		 537 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  43.18 
 
 		 535 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  43.3 
 
 		 533 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  40.86 
 
 		 538 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  41.9 
 
 		 541 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  43.1 
 
 		 570 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  43.1 
 
 		 570 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  40.76 
 
 		 561 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  43.1 
 
 		 570 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>