148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0595 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0595  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  100 
 
 		 521 aa  1031    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1178  multicopper oxidase type 3  34.84 
 
 		 575 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  32.75 
 
 		 547 aa  207  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  29.38 
 
 		 528 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  29.57 
 
 		 496 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  30.17 
 
 		 490 aa  146  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  30.4 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  35.23 
 
 		 645 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  29.58 
 
 		 551 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  28.94 
 
 		 486 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  25.55 
 
 		 569 aa  110  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  30.77 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0334  repressor protein for FtsI  29.39 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  28.63 
 
 		 471 aa  107  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0665  repressor protein for FtsI  28.84 
 
 		 474 aa  106  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  27.46 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0583  repressor protein for FtsI  28.84 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  27.46 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  27.46 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0274  repressor protein for FtsI  28.84 
 
 		 474 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  27.46 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  27.46 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  27.46 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  27.46 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  27.46 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  29.28 
 
 		 516 aa  105  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0341  repressor protein for FtsI  29.17 
 
 		 471 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3428  repressor protein for FtsI  27.66 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  25.11 
 
 		 533 aa  101  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3422  repressor protein for FtsI  27.66 
 
 		 470 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3358  repressor protein for FtsI  27.66 
 
 		 470 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.246662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3353  repressor protein for FtsI  27.66 
 
 		 470 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3523  repressor protein for FtsI  27.66 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  26.42 
 
 		 505 aa  99  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  28.7 
 
 		 499 aa  97.8  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  27.41 
 
 		 487 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  26.17 
 
 		 504 aa  95.5  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  26.9 
 
 		 519 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  29.97 
 
 		 570 aa  94.4  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  29.27 
 
 		 508 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3425  repressor protein for FtsI  26.43 
 
 		 470 aa  94.4  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  27.84 
 
 		 532 aa  94.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  26.33 
 
 		 470 aa  94.4  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  25.63 
 
 		 510 aa  93.6  9e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  26.12 
 
 		 519 aa  92.8  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  24.75 
 
 		 538 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  27.85 
 
 		 512 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  31.36 
 
 		 506 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  29.29 
 
 		 535 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  29.04 
 
 		 535 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  25.92 
 
 		 488 aa  91.7  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3767  repressor protein for FtsI  28.72 
 
 		 470 aa  91.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  29.04 
 
 		 535 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  30.99 
 
 		 551 aa  90.9  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  29.65 
 
 		 533 aa  90.1  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2196  multicopper oxidase  31.03 
 
 		 556 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  30.07 
 
 		 524 aa  89.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  27.56 
 
 		 679 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  25.16 
 
 		 534 aa  87.4  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  25.16 
 
 		 534 aa  87.4  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  30.18 
 
 		 625 aa  87.4  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  29.26 
 
 		 531 aa  87.4  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  27.42 
 
 		 516 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  26.59 
 
 		 515 aa  87  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  26.89 
 
 		 529 aa  87  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  26.89 
 
 		 529 aa  87  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  26.89 
 
 		 529 aa  87  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  28.79 
 
 		 535 aa  86.7  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  26.89 
 
 		 516 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  29.02 
 
 		 536 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  29.02 
 
 		 536 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  29.02 
 
 		 536 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  27.42 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  27.42 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  29.02 
 
 		 536 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  29.02 
 
 		 536 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  27.42 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  27.42 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  30.77 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  30.77 
 
 		 533 aa  83.6  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  25.77 
 
 		 502 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  25.77 
 
 		 502 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  29.41 
 
 		 532 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  30.77 
 
 		 533 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0500  cell division protein SufI  29.05 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  25 
 
 		 519 aa  80.1  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  24.79 
 
 		 528 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  25.55 
 
 		 677 aa  77.4  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  24.63 
 
 		 514 aa  77.4  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  26.59 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  25.71 
 
 		 536 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  23.19 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  22.87 
 
 		 513 aa  73.6  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  24.49 
 
 		 536 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.87 
 
 		 579 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  27 
 
 		 536 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  27 
 
 		 536 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  30.14 
 
 		 631 aa  70.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  27 
 
 		 676 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  30.28 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>