More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0463 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1426  dihydroorotase, multifunctional complex type  79.62 
 
 
426 aa  647    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0463  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
422 aa  854    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0936737 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2965  dihydroorotase  71.56 
 
 
426 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1870  dihydroorotase, multifunctional complex type  64.27 
 
 
420 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  61.81 
 
 
437 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  61.61 
 
 
434 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.69767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  46.67 
 
 
422 aa  358  7e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.19 
 
 
425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.93 
 
 
425 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.5 
 
 
429 aa  350  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.81 
 
 
424 aa  350  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.26 
 
 
425 aa  348  9e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.47 
 
 
427 aa  346  5e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.19 
 
 
424 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  44.36 
 
 
426 aa  339  5e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.94 
 
 
425 aa  339  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.06 
 
 
429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  44.42 
 
 
425 aa  332  5e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.55 
 
 
436 aa  331  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.13 
 
 
428 aa  330  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  44.37 
 
 
427 aa  325  1e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.63 
 
 
434 aa  323  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  45.35 
 
 
442 aa  322  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.18 
 
 
430 aa  320  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.43 
 
 
433 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.13 
 
 
429 aa  320  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  43.43 
 
 
436 aa  319  7e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  44.6 
 
 
427 aa  319  7e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  44.65 
 
 
431 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  44.65 
 
 
431 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.97 
 
 
434 aa  318  9e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.13 
 
 
434 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  44.65 
 
 
431 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.23 
 
 
433 aa  316  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  45.18 
 
 
431 aa  316  5e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  42.79 
 
 
423 aa  315  7e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.9 
 
 
433 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.02 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  40.82 
 
 
426 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  45.9 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.93 
 
 
439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.94 
 
 
429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.43 
 
 
433 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  41.98 
 
 
428 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.8 
 
 
437 aa  309  5e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  41.94 
 
 
431 aa  309  8e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.65 
 
 
429 aa  308  9e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  42.71 
 
 
426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  45.28 
 
 
435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  44.15 
 
 
430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  46.53 
 
 
431 aa  306  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  44.03 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.26 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.19 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.43 
 
 
433 aa  302  6.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.53 
 
 
437 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  45.31 
 
 
433 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  42.92 
 
 
430 aa  300  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  44.53 
 
 
431 aa  300  4e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.34 
 
 
430 aa  299  6e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  42.79 
 
 
425 aa  296  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5244  dihydroorotase  43.56 
 
 
433 aa  296  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937093  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.38 
 
 
432 aa  295  1e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  42.14 
 
 
449 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  43.36 
 
 
458 aa  294  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2337  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.82 
 
 
436 aa  294  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.64 
 
 
435 aa  293  3e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  41.34 
 
 
425 aa  293  5e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.76 
 
 
430 aa  292  8e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  43.29 
 
 
430 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  41.92 
 
 
448 aa  291  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1324  dihydroorotase  42.72 
 
 
454 aa  290  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.198693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  42.14 
 
 
462 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  43.02 
 
 
431 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  41.55 
 
 
428 aa  288  1e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  41.63 
 
 
425 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  42.43 
 
 
432 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  40 
 
 
425 aa  287  2e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.95 
 
 
473 aa  286  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  42.58 
 
 
432 aa  286  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  41.94 
 
 
432 aa  286  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  44.26 
 
 
428 aa  286  7e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.06 
 
 
428 aa  285  8e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.27 
 
 
425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  41.94 
 
 
446 aa  282  8.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  41.26 
 
 
429 aa  279  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.01 
 
 
448 aa  280  5e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 
426 aa  279  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3201  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.8 
 
 
447 aa  279  6e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.2 
 
 
431 aa  279  7e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12670  dihydroorotase  43.56 
 
 
446 aa  277  3e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0696106 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  38.53 
 
 
440 aa  276  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  38.83 
 
 
442 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  38.63 
 
 
428 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1707  dihydroorotase  39.42 
 
 
451 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  37.26 
 
 
430 aa  271  2e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  38.58 
 
 
446 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  38.63 
 
 
428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  38.63 
 
 
428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  40.68 
 
 
440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>