32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2733 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 406 aa  835    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1104  von Willebrand factor, type A  80.88 
 
 		 420 aa  638    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2368  von Willebrand factor, type A  72.64 
 
 		 402 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0012043  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  23.88 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  27.96 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  34.43 
 
 		 500 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  27.57 
 
 		 549 aa  66.6  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  41.73 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  25.79 
 
 		 605 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  27.56 
 
 		 568 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  29.47 
 
 		 631 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  25.13 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3199  von Willebrand factor type A  28.97 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.930737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  28.19 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  27.13 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  22.9 
 
 		 568 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0614  hypothetical protein  26.36 
 
 		 503 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  26.87 
 
 		 602 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  23.68 
 
 		 582 aa  50.1  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  27.62 
 
 		 553 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  26.18 
 
 		 666 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  28.74 
 
 		 562 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  27.09 
 
 		 456 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  29.17 
 
 		 566 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  29.84 
 
 		 566 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  39.62 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  43.48 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  45.65 
 
 		 356 aa  43.9  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  32.76 
 
 		 477 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  27.18 
 
 		 563 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 308 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  28.81 
 
 		 412 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>