52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2114 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  100 
 
 		 243 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  53.76 
 
 		 187 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  50.89 
 
 		 195 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  42.86 
 
 		 191 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  46.11 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  50.28 
 
 		 1128 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  45.28 
 
 		 185 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  46.15 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  40.84 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  40.48 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  57.25 
 
 		 194 aa  138  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  41.88 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  46.59 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  42.86 
 
 		 188 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  41.88 
 
 		 190 aa  135  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  41.88 
 
 		 190 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  41.88 
 
 		 190 aa  134  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  41.88 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  41.25 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  42.5 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  41.88 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  41.88 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  44.89 
 
 		 196 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  36.99 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  47.56 
 
 		 189 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  40.62 
 
 		 190 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  41.25 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  37.28 
 
 		 188 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  46.95 
 
 		 235 aa  124  9e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  39.63 
 
 		 187 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  39.63 
 
 		 187 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  40 
 
 		 182 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  36.22 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  44.58 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  35.47 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  39.11 
 
 		 195 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  42.39 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  42.68 
 
 		 192 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  33.95 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  34.09 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  43.62 
 
 		 201 aa  98.6  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  43.06 
 
 		 196 aa  94.7  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  47.67 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  32.72 
 
 		 181 aa  92.4  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  29.34 
 
 		 183 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  29.34 
 
 		 183 aa  88.6  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  29.93 
 
 		 475 aa  53.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0633  SAM-dependent methyltransferase  30.51 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2515  methyltransferase type 11  46.94 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.245025  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  46 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  46 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 186 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>