260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1255 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  704    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  85.71 
 
 		 360 aa  578  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  51.94 
 
 		 357 aa  362  8e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  32.51 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  33.42 
 
 		 369 aa  185  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  33.62 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  35.43 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  36.68 
 
 		 355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  33.68 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  32.2 
 
 		 390 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  37.54 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  36.3 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  35.17 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  33.9 
 
 		 354 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  33.57 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  33.57 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  35 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  32.34 
 
 		 339 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  34.38 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  25.87 
 
 		 337 aa  132  9e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  31.02 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  30.25 
 
 		 331 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  27.64 
 
 		 377 aa  122  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  26.99 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  30.23 
 
 		 421 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  27.44 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  26.77 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  28.04 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  29.33 
 
 		 359 aa  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  26.28 
 
 		 416 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  32.26 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  29.75 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  27.78 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  26.44 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  28.36 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  28.53 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  30.96 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  29.7 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  29.34 
 
 		 436 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  30.93 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  31.54 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  30.06 
 
 		 473 aa  99.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  28.19 
 
 		 369 aa  99.4  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  29.64 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  33.81 
 
 		 341 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  30.69 
 
 		 442 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  34.92 
 
 		 347 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  30.17 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  26.67 
 
 		 372 aa  96.7  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51806  inner membrane protein  26.7 
 
 		 441 aa  96.3  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.959187  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  28.86 
 
 		 380 aa  95.9  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  28.18 
 
 		 357 aa  95.9  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  29.01 
 
 		 355 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  31.19 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  28.53 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  29 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  25.78 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  27.17 
 
 		 340 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  26.09 
 
 		 340 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  25.94 
 
 		 340 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  27.82 
 
 		 328 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  27.14 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  27.14 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  26.27 
 
 		 352 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  25.65 
 
 		 340 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  27.14 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  27.14 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  27.14 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  27.14 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  27.14 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  28.29 
 
 		 442 aa  92.8  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  27.14 
 
 		 349 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  26.19 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  25.89 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  25.65 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  25.6 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  28.1 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  25.94 
 
 		 411 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  25.29 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  27.81 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  27.81 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  27.81 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  27.81 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  29.73 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  26.09 
 
 		 340 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  27.51 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  29.24 
 
 		 361 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  24.32 
 
 		 331 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  26.57 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  25.8 
 
 		 337 aa  89.7  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  30.25 
 
 		 450 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  29.17 
 
 		 348 aa  89.7  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  27.46 
 
 		 356 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  27.62 
 
 		 362 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  27.62 
 
 		 362 aa  89.7  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  27.62 
 
 		 362 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  27.12 
 
 		 356 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  28.21 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  29.47 
 
 		 436 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>