More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0153 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0153  histidine kinase  100 
 
 
411 aa  809    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.519807  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
491 aa  189  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
465 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0784  histidine kinase  30.22 
 
 
408 aa  177  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0431535  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  33.43 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  31.07 
 
 
452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  31.07 
 
 
452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  34.97 
 
 
497 aa  166  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  30.77 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
366 aa  161  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  33.23 
 
 
472 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
513 aa  159  8e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  33.87 
 
 
471 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  33.87 
 
 
471 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  34.01 
 
 
397 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
470 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
478 aa  145  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  30.53 
 
 
481 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
524 aa  143  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0492  sensor histidine kinase/response regulator  32.03 
 
 
369 aa  142  7e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  36.3 
 
 
469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
482 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  30.27 
 
 
451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  29.24 
 
 
456 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  32.79 
 
 
477 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
474 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  31.62 
 
 
469 aa  136  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
504 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1092  Signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
441 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0028584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
477 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1700  Signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
429 aa  136  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0217075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
469 aa  136  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0489  Signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
470 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  34.15 
 
 
461 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
438 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
479 aa  133  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
459 aa  133  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  33.74 
 
 
494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  28.74 
 
 
443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
500 aa  130  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
457 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
475 aa  131  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3687  histidine kinase  33.21 
 
 
437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0736  histidine kinase  31.96 
 
 
508 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  30.32 
 
 
490 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1624  sensor histidine kinase CsrS  27.3 
 
 
501 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0265731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  28.74 
 
 
458 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  28.4 
 
 
443 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  29.76 
 
 
468 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  32.69 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  29.45 
 
 
486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
469 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  31.11 
 
 
436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  31.01 
 
 
436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  31.33 
 
 
436 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  31.11 
 
 
457 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  31.11 
 
 
457 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
455 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  26.36 
 
 
457 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 
447 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  26.61 
 
 
475 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  25.41 
 
 
483 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0899  Signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
382 aa  124  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218475  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  29.46 
 
 
473 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
498 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
614 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2267  histidine kinase  27.36 
 
 
488 aa  123  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.643176  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
494 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205358  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  29.72 
 
 
466 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.03 
 
 
466 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3399  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  26.07 
 
 
481 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2193  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2481  heavy metal sensor histidine kinase  26.56 
 
 
461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000221939  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  26.43 
 
 
473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2085  heavy metal sensor histidine kinase  26.56 
 
 
461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000557758  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.29 
 
 
450 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  27.3 
 
 
454 aa  120  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
452 aa  120  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  31.53 
 
 
481 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  29.21 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
462 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  28.53 
 
 
482 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
614 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1850  histidine kinase  27.89 
 
 
458 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456311  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  25.74 
 
 
484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
495 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  28.71 
 
 
477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
591 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  25.74 
 
 
484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>