34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4087 on replicon NC_009958
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009958  Dshi_4087  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 97 aa  199  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.0167835 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06885  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2801  plasmid stabilization system protein  37.65 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0123  plasmid stabilization system  37.63 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0115  plasmid stabilization system  36.56 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08247  plasmid stabilization protein ParE  34.69 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0088  plasmid stabilization protein ParE, putative  31.76 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.839855  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0191  plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1990  plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5431  plasmid stabilization system  32.22 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3471  plasmid stabilization system protein  31.76 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1161  plasmid stabilization system  34.44 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063837 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0900  putative plasmid stabilization element ParE  33.67 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.606643  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0079  hypothetical protein  35.16 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5138  plasmid stabilization system  34.94 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2746  plasmid stabilization system  32.14 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0004  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.52 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.232384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1734  plasmid stabilization system  29.35 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4670  plasmid stabilization system protein  26.74 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  32.95 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3092  plasmid stabilization system protein  32.53 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0937  hypothetical protein  30.34 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0443  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  34.88 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0491  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  33.72 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01565  Plasmid stabilization system A  33.72 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2911  hypothetical protein  30.53 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2644  plasmid stabilization protein  30.95 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0024  plasmid stabilization system protein  28.4 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.573252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2490  plasmid stabilization system  31.76 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1561  hypothetical protein  29.03 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1796  plasmid stabilization system  32.94 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1517  plasmid stabilization system protein  32.94 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.344255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0711  plasmid stabilization system protein  28.74 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0781946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4221  hypothetical protein  27.27 
 
 		 97 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>