More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1041 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
348 aa  716    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.66 
 
 
355 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.35 
 
 
354 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.66 
 
 
367 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.28 
 
 
351 aa  287  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.82 
 
 
353 aa  285  9e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.99 
 
 
351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.58 
 
 
354 aa  282  6.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.13 
 
 
354 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.06 
 
 
363 aa  277  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.71 
 
 
354 aa  276  5e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.66 
 
 
357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.86 
 
 
354 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  38.08 
 
 
363 aa  270  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  41.09 
 
 
354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.55 
 
 
353 aa  269  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.71 
 
 
547 aa  268  7e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  41.04 
 
 
365 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.26 
 
 
354 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.84 
 
 
374 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.68 
 
 
353 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.52 
 
 
354 aa  261  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.56 
 
 
341 aa  259  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.16 
 
 
353 aa  259  4e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  38.51 
 
 
358 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.86 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  39.24 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  38.95 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.84 
 
 
357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  37.64 
 
 
380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  37.03 
 
 
375 aa  249  7e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.23 
 
 
372 aa  248  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.14 
 
 
395 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.14 
 
 
376 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.64 
 
 
360 aa  244  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.39 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.82 
 
 
381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  39.27 
 
 
354 aa  243  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.46 
 
 
387 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.18 
 
 
372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.42 
 
 
355 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.52 
 
 
355 aa  238  9e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.73 
 
 
356 aa  237  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.44 
 
 
375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.1 
 
 
352 aa  235  9e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.9 
 
 
390 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.02 
 
 
385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.02 
 
 
385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.89 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.31 
 
 
362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.5 
 
 
352 aa  232  6e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.49 
 
 
354 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.11 
 
 
353 aa  227  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.39 
 
 
379 aa  223  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.77 
 
 
368 aa  219  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  32.69 
 
 
367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.58 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
356 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.63 
 
 
357 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.64 
 
 
360 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.56 
 
 
351 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.72 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.16 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.91 
 
 
355 aa  199  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.29 
 
 
327 aa  196  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.78 
 
 
374 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.31 
 
 
381 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.31 
 
 
381 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.71 
 
 
321 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.25 
 
 
332 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.67 
 
 
327 aa  172  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.03 
 
 
339 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.66 
 
 
333 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.72 
 
 
316 aa  170  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.45 
 
 
339 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.72 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1091  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.17 
 
 
322 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.21 
 
 
325 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.39 
 
 
316 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  31.39 
 
 
316 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  31.39 
 
 
316 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.39 
 
 
316 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  31.39 
 
 
320 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.9 
 
 
325 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  29.81 
 
 
325 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.02 
 
 
316 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.02 
 
 
320 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.99 
 
 
324 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.8 
 
 
322 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.66 
 
 
316 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.02 
 
 
316 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.66 
 
 
316 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0150  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  31.52 
 
 
345 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2098  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.72 
 
 
323 aa  149  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.41 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.93 
 
 
325 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1813  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.19 
 
 
367 aa  146  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.406453  normal  0.0884578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.28 
 
 
325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0789  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28.72 
 
 
322 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.957399  normal  0.0628578 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.58 
 
 
325 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>