58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3185 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  53.95 
 
 		 656 aa  718    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0335  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  56.39 
 
 		 642 aa  717    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  50.7 
 
 		 621 aa  638    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0870  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  52.85 
 
 		 628 aa  660    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.404437  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3185  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  100 
 
 		 679 aa  1399    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.579976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2566  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  51.77 
 
 		 663 aa  689    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3525  carbon monoxide dehydrogenase  50.23 
 
 		 624 aa  637    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1341  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  51.1 
 
 		 623 aa  626  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0842  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.78 
 
 		 629 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.183197  normal  0.106762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1272  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  46.77 
 
 		 628 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2875  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.64 
 
 		 626 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.843098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1234  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.92 
 
 		 629 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0405701  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0382  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.67 
 
 		 631 aa  538  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.74 
 
 		 653 aa  538  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0618  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.86 
 
 		 641 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0057  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.54 
 
 		 645 aa  528  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.612526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  45.01 
 
 		 629 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2098  carbon monoxide dehydrogenase subunit  45.09 
 
 		 640 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3028  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.93 
 
 		 625 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  44.41 
 
 		 635 aa  512  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  43.88 
 
 		 629 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0934  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.86 
 
 		 627 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502316  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  41.53 
 
 		 673 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4498  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.55 
 
 		 663 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0072  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  42.2 
 
 		 635 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.78 
 
 		 674 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  39.58 
 
 		 674 aa  452  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3792  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  38.81 
 
 		 635 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.117932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1427  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.24 
 
 		 639 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2798  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  38.62 
 
 		 672 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  40.97 
 
 		 632 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  36.95 
 
 		 655 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1736  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.89 
 
 		 666 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.306274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2801  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  35.38 
 
 		 670 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0236  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.14 
 
 		 679 aa  352  1e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1131  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.41 
 
 		 676 aa  350  4e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000338326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1902  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  34.49 
 
 		 669 aa  349  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268472  hitchhiker  0.000000000000110792 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0438  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.3 
 
 		 663 aa  317  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000530778  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0149  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  32.16 
 
 		 680 aa  301  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0860  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.76 
 
 		 695 aa  300  6e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.199727  normal  0.922779 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2918  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.69 
 
 		 710 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0596914  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1216  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  29.74 
 
 		 648 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.655192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0652  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  31.08 
 
 		 707 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00052858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1166  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30 
 
 		 637 aa  283  9e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3717  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.91 
 
 		 634 aa  276  7e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0888  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.94 
 
 		 629 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2933  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  30.02 
 
 		 623 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000257353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0105  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  25.11 
 
 		 766 aa  51.6  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0475  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  21.23 
 
 		 768 aa  50.4  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.908557  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2271  hydroxylamine reductase  25.14 
 
 		 550 aa  48.9  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663099  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1326  hydroxylamine reductase  28.57 
 
 		 545 aa  48.5  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.611962  normal  0.884501 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2371  hydroxylamine reductase  25.7 
 
 		 550 aa  48.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0749  hydroxylamine reductase  26.55 
 
 		 543 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000113817  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0227  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  26.7 
 
 		 778 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0219  hydroxylamine reductase  25 
 
 		 538 aa  44.7  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0754  hydroxylamine reductase  27.11 
 
 		 552 aa  44.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0596  hydroxylamine reductase  25.37 
 
 		 535 aa  43.9  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0690  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  22.02 
 
 		 787 aa  43.9  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.676741  normal  0.475894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>