42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1890 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1890  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 440 aa  910    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.835954  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1766  radical SAM domain-containing protein  51.67 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3074  Radical SAM domain protein  46.3 
 
 		 431 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0495  radical SAM domain-containing protein  45.96 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1302  radical SAM domain-containing protein  45.03 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2730  radical SAM family protein  44.11 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0860  Radical SAM domain protein  43.79 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3386  Radical SAM domain protein  44.03 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0663552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2996  radical SAM domain-containing protein  43.95 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0886  radical SAM domain-containing protein  44.5 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73593  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0047  Radical SAM domain protein  46.23 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1234  Radical SAM domain protein  45 
 
 		 440 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1667  radical SAM domain-containing protein  46.23 
 
 		 491 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0738152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  44.03 
 
 		 423 aa  353  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1952  Radical SAM domain protein  46.98 
 
 		 481 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000720024  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0203  Radical SAM domain protein  45.97 
 
 		 511 aa  341  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.092669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1676  Elongator protein 3/MiaB/NifB  43.23 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0061  Radical SAM domain protein  39.38 
 
 		 421 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000135006  hitchhiker  0.00291545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2405  radical SAM domain-containing protein  38.31 
 
 		 418 aa  278  9e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000316663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2171  radical SAM domain-containing protein  42.56 
 
 		 427 aa  265  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2377  radical SAM family protein  39.08 
 
 		 446 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1582  Radical SAM domain protein  38.39 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1487  Radical SAM domain protein  38.39 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1490  radical SAM domain-containing protein  35.94 
 
 		 444 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.221891 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0024  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.91 
 
 		 309 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  27.5 
 
 		 342 aa  50.1  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1156  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.64 
 
 		 322 aa  50.1  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  22.56 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 320 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.36 
 
 		 321 aa  47  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 287 aa  47  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  30.61 
 
 		 319 aa  47  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 287 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0881  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.87 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659843  hitchhiker  0.00030609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.23 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1947  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.83 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.386779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1728  hypothetical protein  23.79 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.241184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  25.62 
 
 		 336 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  29.93 
 
 		 349 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 346 aa  43.5  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.82 
 
 		 359 aa  43.1  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>