24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1852 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1852  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  560  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.428196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1851  hypothetical protein  49.31 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4083  solute binding protein-like  27.38 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0424858  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0719  hypothetical protein  29.41 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000971081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  30.77 
 
 		 2454 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  26.32 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1675  hypothetical protein  33.02 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1345  hypothetical protein  28.5 
 
 		 3121 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1970  hypothetical protein  29.48 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000904058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  26.82 
 
 		 554 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4670  hypothetical protein  32.32 
 
 		 164 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1810  hypothetical protein  26.09 
 
 		 556 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.131395  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  49.7  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0634  hypothetical protein  26.28 
 
 		 146 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000800273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  25.34 
 
 		 1237 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  29.06 
 
 		 1334 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1759  hypothetical protein  23.91 
 
 		 602 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00474122  normal  0.0887156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2345  hypothetical protein  24.74 
 
 		 581 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.722674  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3155  hypothetical protein  23.71 
 
 		 576 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  25.34 
 
 		 2039 aa  45.8  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3753  hypothetical protein  27.78 
 
 		 335 aa  45.8  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1557  hypothetical protein  25.96 
 
 		 235 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 1272 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1991  hypothetical protein  27.47 
 
 		 143 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.76176  normal  0.495244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>