35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_790 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  79.92 
 
 		 250 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  81.4 
 
 		 244 aa  374  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  48.95 
 
 		 243 aa  225  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  46.72 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  52.5 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  48.37 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  43.67 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  46.36 
 
 		 245 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  40.62 
 
 		 247 aa  169  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  43.15 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  36.23 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  40.1 
 
 		 248 aa  141  8e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  38.64 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  38.64 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  36.13 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  39.5 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  36.99 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  37.9 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  38.87 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  42.79 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  36.23 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  36.6 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  35.29 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  35 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  38.74 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  36.36 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  39.73 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  37.19 
 
 		 238 aa  92  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  43.98 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  36.08 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0179  hypothetical protein  40 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  34.21 
 
 		 281 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1250  hypothetical protein  40.65 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  37.7 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>