135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_696 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_696  phosphoribosyl transferase domain protein  100 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0790  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  99.59 
 
 		 244 aa  497  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.582964  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0716  phosphoribosyltransferase  96.31 
 
 		 244 aa  460  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  43.35 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  43.35 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  43.35 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  40.89 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1590  phosphoribosyltransferase  42 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0798935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0342  phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  36.71 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1155  phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  39.3 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1135  phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1167  phosphoribosyltransferase  40.49 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal  0.0766272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  33.83 
 
 		 208 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  38.42 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  35.32 
 
 		 219 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  36.23 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  39.34 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 		 441 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4420  phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 		 214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  33.88 
 
 		 682 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0796  phosphoribosyltransferase  37.74 
 
 		 223 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  37.74 
 
 		 679 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  37.74 
 
 		 679 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  33.5 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  37.74 
 
 		 845 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1249  phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0737102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1792  phosphoribosyltransferase  37.56 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00238592  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  38.73 
 
 		 669 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 		 223 aa  128  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_783  phosphoribosyltransferase-like protein  35.38 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  33.33 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  33 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  35.41 
 
 		 211 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  38.98 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  32.68 
 
 		 224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  34.63 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  34.56 
 
 		 885 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  34.56 
 
 		 885 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  41.58 
 
 		 668 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  39.06 
 
 		 418 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  38.42 
 
 		 220 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  36.56 
 
 		 443 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 		 242 aa  122  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  37.44 
 
 		 229 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  38.76 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  36.32 
 
 		 443 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  37.75 
 
 		 681 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 223 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  33.94 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  38.92 
 
 		 210 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 220 aa  118  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  33.5 
 
 		 430 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  37.36 
 
 		 441 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  37.07 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3246  phosphoribosyltransferase  39.6 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1189  phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.267888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3308  phosphoribosyltransferase  39.6 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  decreased coverage  0.00695494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3257  phosphoribosyltransferase  39.6 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413592  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  35.41 
 
 		 437 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  37.24 
 
 		 439 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5577  phosphoribosyltransferase  34.98 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1580  hypothetical protein  32.13 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00205223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  37.25 
 
 		 681 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1078  phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.518737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 		 446 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2613  phosphoribosyltransferase  36.45 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.342013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 		 477 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1814  phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.055799  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  36.1 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  37.07 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  31.92 
 
 		 207 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 		 459 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2042  phosphoribosyltransferase  39.6 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4117  phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 		 238 aa  111  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3164  phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.405407 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1413  putative phosphoribosyl transferase domain protein  33.5 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.767905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  35.78 
 
 		 681 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  37.13 
 
 		 468 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15350  predicted phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.652419  normal  0.519761 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  31.07 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  31.07 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0136  phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00508045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  34.76 
 
 		 884 aa  108  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>