42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_465 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_465  PBS lyase heat-like repeat domain protein  100 
 
 		 316 aa  643    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.089505  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0500  heat domain-containing protein  89.24 
 
 		 316 aa  589  1e-167  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.332473  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0524  HEAT repeat-containing PBS lyase  87.03 
 
 		 316 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.25489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3973  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.84 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629775  normal  0.213011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1417  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.68 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3051  HEAT domain containing protein  35.33 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.593239  hitchhiker  0.000276879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0952  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.69 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0081  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.69 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  26.25 
 
 		 546 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.82 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  27.32 
 
 		 958 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  23.53 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.57 
 
 		 1343 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40.86 
 
 		 641 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.78 
 
 		 642 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1094 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  22.1 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.5 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  27.64 
 
 		 838 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  22.15 
 
 		 501 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.27 
 
 		 220 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  23.94 
 
 		 493 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  24.9 
 
 		 644 aa  49.3  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.15 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  27.39 
 
 		 1133 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05340  riken protein, putative  30.08 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1224 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.52 
 
 		 220 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.52 
 
 		 220 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.78 
 
 		 642 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.36 
 
 		 490 aa  46.6  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.7 
 
 		 162 aa  46.2  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.42 
 
 		 395 aa  46.2  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  23.53 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1181 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  25 
 
 		 157 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  20.77 
 
 		 510 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  24.5 
 
 		 522 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.53 
 
 		 670 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  26.04 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.43 
 
 		 173 aa  43.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.41 
 
 		 192 aa  43.1  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>