More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1523 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1523  aldolase, class II  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.854462  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1641  L-fuculose phosphate aldolase  96.89 
 
 		 193 aa  390  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.515005  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1385  L-fuculose phosphate aldolase  86.98 
 
 		 193 aa  349  1e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.190215  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1249  L-fuculose phosphate aldolase  41.81 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1355  class II aldolase/adducin family protein  40.46 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0389357  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1450  L-fuculose phosphate aldolase  39.31 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.571414  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2210  L-fuculose phosphate aldolase  37.85 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000461155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1027  L-fuculose phosphate aldolase  39.78 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0314  L-fuculose phosphate aldolase  39.01 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1037  class II aldolase/adducin family protein  34.66 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.093036  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3173  L-fuculose phosphate aldolase  41.99 
 
 		 178 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0426  class II aldolase/adducin family protein  38.1 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000249785  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1801  L-fuculose phosphate aldolase  39.33 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30516  normal  0.168684 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1661  L-fuculose phosphate aldolase  38.71 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1529  class II aldolase/adducin family protein  40.88 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599207  normal  0.531556 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0823  class II aldolase/adducin family protein  37.64 
 
 		 196 aa  98.6  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.345059  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2190  class II aldolase and adducin N-terminal domain-containing protein  34.9 
 
 		 388 aa  87  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2288  class II aldolase/adducin-like  32.8 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00052721  normal  0.0891696 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  28.02 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0906  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 385 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58056e-32 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  31.35 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  30.81 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3265  class II aldolase/adducin family protein  31.75 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  31.18 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  31.11 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  29.35 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  32.95 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  30.48 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  26.49 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  32.8 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3340  class II aldolase/adducin family protein  31.72 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  32.46 
 
 		 223 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  32.04 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1876  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000546395  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  27.96 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  29.8 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  29.73 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  27.57 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  31.32 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  28.9 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4089  class II aldolase/adducin family protein  34.04 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  27.84 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  30.77 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  29.65 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  30.77 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  27.86 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  31.03 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  28.73 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  33.91 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  29.63 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  29.73 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  29.95 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  28.57 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  29.76 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  45.36 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  26.98 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3562  L-fuculose-phosphate aldolase  29.09 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.272655  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  27.32 
 
 		 303 aa  64.7  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  29.51 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  30.05 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  31.28 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  28.8 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  31.85 
 
 		 218 aa  64.3  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  29.41 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  30.23 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  31.89 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  29.57 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  30.77 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  29.95 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  26.49 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.100017 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  29.26 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  30.17 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  32.97 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  30.69 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  27.43 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  26.88 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  30.69 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  30.99 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  27.72 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  26.46 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.78 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  29.65 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  30.81 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  30.54 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  26.52 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  30.54 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  33.16 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  30.54 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  29.79 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  28.49 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  28.42 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  30.41 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  31.89 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  27.84 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  30.41 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  30.54 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  30.41 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  30.54 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  31.89 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  25.41 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>